Opvolgen van epigenetische plasticiteit in circulerend tumor DNA met het oog op monitoren van therapie resistentie voor gepersonaliseerde behandeling in kanker patiënten

Benchmarken en optimaliseren van computationele deconvolutie methoden op DNA methylatie profiel van vloeibare biopten bij kankerpatiënten

Doctoraatsproject Jilke De Wilde

Doctoraatsproject Lotte Cornelli

Nucleic acid biomarkers in blood from patients with esophageal adenocarcinoma: Finding the needle in the haystack

Ontwikkeling van een computationele pijplijn voor monitoring van epigenetische plasticiteit in bloedplasma van kankerpatiënten

Ontwikkeling van een minimaal-invasieve test voor accurate diagnose van CUP ("Cancer of Unknown primary") door bepaling van het DNA methylatie profiel

Predictie van respons en toxiciteit bij immuuntherapie van melanoom, nier- en longkanker door een transcriptoom gebaseerde immuunprofilering

Studie van neuroblastoom tumorheterogeniteit via 'single-cell' transcriptoom analyse

Systemic immune epigenomic predictors of immunotherapy response in NSCLC patients: Potential and pitfalls

De samenwerking tussen ZEB1 en epigenetische modulatoren tijdens initiatie en progressie van claudin-low borstkanker.

Doctoraatsproject Annelies Fieuw

From mutations to splice variants: identifying liquid biopsy derived biomarkers in metastatic prostate cancer

Het ontrafelen van regulatorische heterogeniteit in hoog-risico neuroblastoma

Human pluripotent stem cell modeling, from normal development to neuroblastoma

Integratie van meerder omics levels om de epigenetische verschillen in circulerende bloedcellen bij ICI responders en niet-responders te ontrafelen

Molecular characterization of SOX11 as multifaceted epigenetic regulator in neuroblastoma

Multi-omics karakterisering van extracellulaire vesikelsfracties in vloeibare biopsieën voor biomarkeridentificatie

Ontwikkeling van een zeer gevoelige analysemethode voor DNA-methylatie van circulerend celvrij en de toepassing ervan bij de behandeling van kanker.

Validatie en toepassing van nieuwe methodes voor detectie van microsatellietinstabiliteit en methylatie-profiling op paraffine-ingebedde biopsies

Bioinformatica voor toekomstige precisiegeneeskunde in de behandeling van kanker

BOF-ZAP-ambt in Translationele genomica en bio-informatica

Computationele methode om epitheliale-naar-mesenchymale plasticiteit in borstkanker te monitoren door middel van epigenetische analyse van cfDNA.

De SOX11 transcriptiefactor als "lineage survival" oncogen in neuroblastoom

Differentiële netwerk methoden voor het onderscheiden van neuroblastoma subtypes.

Een allesomvattende atlas en pijplijn voor integratieve multimodale single-cell analyse van PBMCs

Een pragmatische klinische studie van SIOPEN om neuroblastoma terugval te monitoren met vloeibare biopsie

Een snelle, minimaal-invasieve en betaalbare test voor accurate diagnose van 'CUP' (Cancer of Unknown Primary: metastatische kanker van onbekende oorsprong) door bepaling van het DNA methylatie profiel.

Expressieprofilering van individuele neuroblastoomcellen in de zoektocht naar behandelingsmogelijkheden voor chemoresistente ziekte

Het Neuroblastoma 17Q enigma: gebruik van zebravis modelering om de coöperatieve rol van 17Q genen in MYCN gedreven tumor formatie te bestuderen

International Thematic Network - PrIOMiC 2023-2024

Karakterisatie van regulatorische heterogeniteit in hoog-risico neuroblastoom

Niet-invasieve medicatie-identificatie voor tumoren (NIDIT): een hulpmiddel voor precisiek oncologie

Niet-invasieve predictie van immuuntherapie respons bij longkankerpatiënten

Niet-invasieve predictie van immuuntherapie respons voor longkanker patiënten

NIPITplus, een multi-kanker bloed test om immuun checkpoint inhibitie respons te voorspellen en toxiciteit te monitoren

Non-invasive drug identification for tumors: a tool for precision oncology

Ontwikkeling van een data-analyse pijplijn voor drug doelwit identificatie uit het circulerend transcriptoom van longtumor patiënten.

Ontwikkeling van een minimaal-invasieve test voor accurate diagnose van CUP ("Cancer of Unknown primary") door bepaling van het DNA methylatie profiel

Ontwikkeling van een niet-invasieve test voor het voorspellen van immuuntherapie respons bij longkanker

Ontwikkeling van een toolbox voor temporele monitoring van pediatrische kankers gebruik makend van vloeibare biopsieën

Predictie van immuuntherapie response en toxiciteit in melanoom, nier- en longkanker door een transcriptoom gebaseerde immuun profilering.

SOX11 gecontroleerde SWI / SNF combinatorische assemblage en neuroblastoom super-enhancer landschapsarchitectuur

Translationele onco-genomica en bio-informatica in kankeronderzoek

Universeel, kosten-effectief open-source technologieplatform voor lichaamsvloeistof-biopsie met hoge gevoeligheid, gebaseerd op het profileren van het methyloom van circulerend DNA.

DNA methylatie in Common Variable Immunodeficiencies (CVID): een gedetailleerde studie naar DNA methylatie heterogeniteit en relatie met ziekte klassificatie

Fotolitografische DNA printer voor massaal parallelle synthese van DNA oligonucleotiden voor ruimtelijke -omics en hybrid capture target enrichment toepassingen

FullPicture: Combinatie van Spectrale Flow Cytometrie met Hoge-Snelheid Cellulaire Beeldvorming om een gedetailleerde analyse van planten- en dierencellen mogelijk te maken

Functionele studie van de ALK-F1174 mutatie in neuroblastoma

Gen-omgevingsinteracties in de pathogenese van longaandoeningen veroorzaakt door roken

Ontwikkeling van een zeer gevoelige circulerende celvrije DNA-methylatie-analysemethode en de toepassing ervan bij de behandeling van kanker

Reconstructie van dynamische initiatie en progressie genexpressie regulatorische netwerken in neuroblastoom

SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele cel

ThirdGenT linkt levenswetenschappen met derde-generatie sequenering van (epi)genomen, (epi)transcriptomen en translatomen: impact op kanker, zeldzame ziekten, microbiologie, cel- en gentechnologie, ontwikkelings- en computationele biologie

BOF-ZAP-ambt in Translationele genomica en bio-informatica

Reconstructie van m(i)RNA regulatorische netwerken betrokken in invasie en metastase in neuroblastoom

Studie van neuroblastoom oncogenese door mRNA en miRNA expressieprofilering van normale neuroblasten en neuroblastoom stamcellen

Replicatievork protectiefactoren als nieuwe doelwitten voor ombinatietherapie en immunomodulering (REINFORCE)