Ons laboratorium heeft cf-RRBS ontwikkeld om DNA-methylatie op circulerend vrij DNA te analyzeren, waardoor diagnostiek aan de hand van vloeibare biopten bij kanker mogelijk wordt. Uit vroegere klinische studies is echter gebleken dat de detectielimiet van cf-RRBS rond 3-5% tumorfractie ligt, wat moet worden verbeterd voor toepassingen in vroege diagnostiek en minimaal resterende ziekte. Ons doel is om de volgende generatie hooggevoelige cf-RRBS te ontwikkelen door innovatiestappen te ondernemen zodat de gevoeligheid met een factor 10 wordt verhoogd tot 0,5%. Vervolgens zullen we onze methode testen in bruikbare klinische studies: vroege diagnose van hepatocellulair carcinoom (HCC) bij cirrosepatiënten en prognose van eerstelijns geneesmiddel therapie bij diffuus grootcellig B-lymfoom (DLBCL) en ER+ borstkanker. Om het potentieel van cf-RRBS bij de ontdekking van biomarkers aan te tonen, zullen we de gegevens uit de klinische studies gebruiken om differentieel gemethyleerde regio's te identificeren die verband houden met deze verschillende klinische vragen. In toekomstig werk zullen deze ook nuttig zijn voor het volgen van minimale resterende ziekte na behandeling van deze tumortypen.