De aanwezigheid van tumorale heterogeniteit in tijd en ruimte vormt een uitdaging voor de implementatie van omics-technologieën voor precisieoncologie. Daarom is er een groeiende interesse in de ontwikkeling en toepassing van hulpmiddelen die de detectie en monitoring van intra-tumorale, ruimtelijke en temporele heterogeniteit bij kankerpatiënten mogelijk maken. De afgelopen jaren heeft mijn team gerenommeerde expertise in dit veld verworven door het analyseren van nucleïnezuren in vloeibare biopten die de intra-tumorale/ruimtelijke heterogeniteit op een bepaald tijdstip kunnen vastleggen, maar ook analyse van temporele heterogeniteit mogelijk maken via longitudinale staalname van vloeibare biopten tijdens de behandeling van de patiënt. Daarnaast hebben we de afgelopen jaren expertise opgedaan in single-cell/nucleus sequencing, wat een nieuw inzicht biedt in de heterogeniteit van complexe weefsels zoals tumoren en bloed.

Voor de komende 4 jaar is het overkoepelende onderzoeksdoel van het lab de ontwikkeling van analytische en bio-informatica omics-pijplijnen die het in kaart brengen van de (epi)genetische heterogeniteit van tumoren en hun micro-omgeving mogelijk maken, wat verder bijdraagt aan kankerdiagnose, therapieresponsvoorspelling en tumorbewaking, waardoor een preciezere klinische behandeling van kankerpatiënten mogelijk wordt. Daartoe passen we multi-ome single-cell/nucleus sequencing toe op bloed- en tumorweefselstalen. Daarnaast beogen we meer fundamenteel begrip te verkrijgen over de afgifte van nucleïnezuren in de bloedbaan en in andere vloeibare biopten, wat zal bijdragen aan het in kaart brengen van het volledige potentieel van (epi)genetische analyse van vloeibare biopten voor een verbeterd klinisch management van kankerpatiënten.