Cofinanciering core facility - ProGenTomics

Een nieuw fragment-gecentreerd perspectief op proteomics.

Cel-gebaseerd niet-invasief prenataal testen: aanrijking van circulerende trofoblasten en genetische analyse.

Collaboratieve wetenschap: van methode ontwikkeling voor proteomics tot kernfaciliteit.

De wondere wereld van histonen en stamcellen: een sprookje geschreven door massaspectrometrie.

Doctoraatsproject Ann-Sophie Vander Plaetsen

Doctoraatsproject Bart Broeckx

Doctoraatsproject Christophe Van Neste

Doctoraatsproject Elisabeth Govaert

Doctoraatsproject Ellen Scheerlinck

Doctoraatsproject Franck Limonier

Doctoraatsproject Laura Corveleyn

Doctoraatsproject Laura De Clerck

Doctoraatsproject Laura Van Hoyweghen

Doctoraatsproject Liesbeth Vossaert

Doctoraatsproject Marie-Alice Fraiture

Doctoraatsproject Marjolein D'Hollander

Doctoraatsproject Nicky Van Thuyne

Doctoraatsproject Nicolas Scarcez

Doctoraatsproject Paulien Meert

Doctoraatsproject Pieter Glibert

Doctoraatsproject Sander Willems

Doctoraatsproject Sandra Soetaert

Doctoraatsproject Senne Cornelis

Doctoraatsproject Shahid Hussain

Doctoraatsproject Trees Lepez

Doctoraatsproject Veerle Gobin

ENSURED - Nieuwe open strategie om te waken over de puurheid van commerciële microbiële fermentatie voeding: voedingssupplementen en vitamines als proof of concept

Epische proteomics: een MS-gebaseerde workflow voor de parallelle profilering van histon epigenetica en proteïne expressie

Hulpmiddelen voor het overbruggen van ontdekkingsproteomica en pandemische paraatheid.

Karakterisatie van voedsel- en voedingsmengsels aan de hand genetische toepassingen: Identificatie van genoom-gemodificeerde planten als onderzoekscasus

Massaspectrometrie gebaseerde forensische eiwitanalyse brengt licht naar het plaats delict

Migratie, voeding en gezondheid van de eerste permanente bewoners van België: inter- en multidisciplinaire perspectieven. (BOF22/GOA/008)

Mobiele pandemische paraatheid: Bijdrage van massa spectrometrie

Single-cell profiling van de histoncode en het proteoom om mechanismen van geneesmiddelenresistentie in acute myeloïde leukemie te ontrafelen.

Strategieën om de aanwezigheid van microbiële onzuiverheden, waaronder genetisch gemodificeerde micro-organismen, te controleren in voedingsenzymen.

Transcriptomische en Epigenomische Analyse: Mechanismen in Vruchtbaarheidsherstel en Oocyte interventies ontrafelen

Doctoraatsproject Amir Jahanshahi

Doctoraatsproject Assia Saltykova

Doctoraatsproject Galbha Duggal

Doctoraatsproject Jitesh Neupane

Doctoraatsproject Maaike Catteeuw

Doctoraatsproject Senne Cornelis

Doctoraatsproject Vanessa Verbeke

Een sequeneringsgerichte toekomst voor verbeterde gezondheidszorg: Verfijning van patiëntgenotypering in gepersonaliseerde geneeskunde en versnelling van de ontwikkeling van monoklonale antilichamen.

Empirische exploratie van nieuwe DNA probes voor hybridisatie met tandem repeats

Farmacogenomics

Het verkennen en optimaliseren van variant detectie en faseringsmethoden in de farmacogenetica.

Immunologische tolerantie bij vitiligo en alopecia areata: ontrafelen van antigeen specificiteit voor potentiële immunotherapie.

Isotherme STR-Analyse met Recombinase Polymerase Amplificatie en Probe-Gebaseerde Genotypering voor Integratie in Microfluïdische Chips

Nanopore-sequencing van complete farmacogenen

RNA-Seq en Bioinformatica Methoden voor het Bestuderen van Embryo Ontwikkeling en Kwaliteit in Rund- en Paardensoorten: Uitdagingen en Kansen.

Verbeterde haplotypering en farmacogenetische predictie met nanopore Cas9-gerichte sequencing

Wetenschap naar het plaats delict gebracht: nieuwe strategieën voor draagbare forensische DNA profilering.

Accurate peptide/proteïne kwantificatie als kwaliteitscontrole en normalisatie template voor biologische proteoom stalen, voorafgaand aan LC-MS/MS analyse, met het Big Lunatic microfluïdisch UV/vis systeem.

Artemisinine biosynthese in Artemisia annua trichomen

Basisuitrusting: Ion Personal Genome Machine TM (PGM TM) Sequencer en Ion Proton TM Sequencer

Bioinformatica : van nucleotiden tot netwerken ( N2N )

Citrullinatie van vimentin in reumatoïde artritis: balanceren op de grens tussen proliferatie en apoptose.

Cofinanciering core facility - UGent NGS Core

Data-onafhankelijke acquisitie massaspectrometrie voor het ontginnen van humane stamcel histonepigenentica.

Data-onafhankelijke acquisitie massaspectroscopie voor het ontginnen van humane stamcel histonepigenetica

Detectie en fenotypering van foetale microchimere cellen in auto-immuun pathologieën

Een Belgische vertegenwoordiging in de Scientific Advice Working Party (SAWP) van het Comité voor geneesmiddelen voor menselijk gebruik (CHMP) van het Europees Geneesmiddelenbureau (EMA).

Een rol voor de T lymfocyt in de productie van antilichamen tegen gecitrullineerde eiwitten in Reumatoïde Artritis

Een weg omheen de tekorten aan reagentia: een MS-gebaseerde test die focust op corona eiwit detectie.

Epic Proteomics: een MS-gebaseerde parallelle analyse van histon epigenetica en proteïne-expressie.

Epigenetische profilering van histonen in farmaco- en toxicoepigenetica

Ex ovo omnia: van stamcel tot eicel

Expertisecentrum voor Sequenering (Life Sciences)

Farmacoepigenetica: opweg naar een gepersonaliseerde behandeling met epidrugs

Farmacoproteomics en genomics de weg naar gepersonaliseerde geneesmiddelen

Geautomatiseerde monsterbereiding om de nood aan analytische capaciteit voor biopharmaceutica en forensische toxicologie in te vullen.

Herstel van fertiliteit door een 3V-aanpak: verjongen, vervangen of verbeteren van de eicel

Identificatie en functionele analyse van signaalmolecules met een mogelijke functie in pluripotentie en differentiatie van embryonale stamcellen

Identificatie van T cel antigene peptiden in MHC complexen op Chronische Lymfocytaire Leukemie B cellen

"Ion mobility" geassisteerde Data Onafhankelijke Acquisitie van de histon code: een aanzet tot peptide-gecentreerde data analyse.

IsoFlux Systeem: Isolatie van laag abundante cellen uit biologische stalen

Kwalitatieve en kwantitatieve analyse van de antigene epitopen van gecitrullineerd vimentine in reumatoïde artritis

Op weg naar een eerste vogelperspectief van de histon code door het gebruik van data-onafhankelijke acquisitie massaspectrometrie.

Op zoek naar causale genetische variatie in kandidaatgenen voor heupdysplasie bij de hond

Pandemie paraatheid: de ontwikkeling van een gemultiplexte massaspectrometrische assay voor de detectie van pathogenen en de geïnduceerde immuunrespons.

Pathways betrokken bij pluripotentie en differentiatie van embryo’s en embryonale stamcellen

"PiTRAQ" als model voor de ontwikkeling van een nieuwe MS-gebaseerde techniek ter opheldering van posttranslationele modificaties

Proteolytische histonklieving tijdens differentiatie van humane stamcellen

Proteomics expertisecentrum Ugent

Snelle histon PTM monitoring aan de hand van MS: het vullen van een leegte in pharmacoepigenetica.

STaR-chip, the ultimate biometric identification check

Trichomen, de sleutel tot een verhoogde productie van artemisinine in Artemisia annua

Uitbreiding van de forensische toolbox: het gebruik van Data-Onafhankelijke Massaspectrometrie voor forensisch peptide marker ontdekking en MRM testontwikkeling.

Volgen van de wijzigingen in het histon-modificatiepatroon met niet-gerichte massaspectrometrie

Wetenschappelijke samenwerking tussen UGent en FAGG

Wetenschappelijke samenwerking tussen UGent en FAGG - 2021-2023 voor lidmaatschap SAWP EMA

Wetenschappelijke samenwerking UGent - FAGG - 2015

Creatie van patiënt eigen stamcellen via somatische cel nucleaire transfer of geïnduceerde pluripotente stamcellen

De ontwikkeling van een specifiek monoclonaal antilichaam tegen deoxynivalenol

De rol van mitogen-activated protein kinases (MAPK) en hun downstream effectoren in tijdelijk stress resistentie bij in vitro geproduceerde runderembryo's

Embryo-maternale interactie bij het paard

Empirische exploratie van nieuwe DNA probes voor hybridisatie met tandem repeats

het SEGa project

Identificatie van genen betrokken in het metabolisme van de Quinoa plant (chenopodium quinoa)

Isolatie en karakterisatie van foetale cellen voor cel-gebaseerde niet-invasieve prenatale genetische diagnose

Kweek-afhankelijke en -onafhankelijke analyse van de bio-film-geassocieerde microflora op endotracheale tubes en hun rol in ventilator-geassocieerde pneumonie

Lab-on-a-Chip (LoC) voor forensische STR-profilering.

Nanopore-sequencing van complete farmacogenen na CRISPR/Cas9-verrijking bij tamoxifen- en clopidogrel-patiënten, waardoor verbeterde haplotypering en voorspelling van de werkzaamheid met machine learning mogelijk is.

Onderzoek naar de moleculaire pathogenese van chlamydophila psitacci in humane macrofagen en epitheelcellen: genomics, proteomics en methylomics van hoog en laag virulente stammen

Onderzoek rond nieuwe analytische uitdagingen voor mycotoxinebepaling: Gemaskeerde ("masked") mycotoxinen

Een geïntegreerde metabolomics benadering om de pathofysiologie van vroegtijdige chronische nierziekte bij katten te ontrafelen.

Karakterisatie van een obees bigmodel om geneesmiddelendosering bij het obese kind te verbeteren

Migratie, voeding en gezondheid van de eerste permanente bewoners van Belgie: inter- en multidisciplinaire perspectieven