PROFETIE: Translationele controle in infectiebiologie: riboproteogenomics van bacteriële pathogenen

BOF-ZAP-ambt in proteomica

Het complementair karakter van ribosoom profilering en positionele proteoom analyse voor de annotatie van translatie startplaatsen en de studie van co-translationele eiwitmodificaties in humane cellijnen.

Het gebruik van ribosoom profilering en positionele proteomics voor de studie van N-terminale eiwitvarianten, hun stabiliteit en lokalisatie

Het ontrafelen van de heterogene aard van gastheer/pathogeen interacties en hun rol in bacteriële pathogenese.

Microarrays voor de fenotypische karakterisatie van reinculturen, bacteriële mutanten en microbiële gemeenschappen

Nieuwe mechanismen van ontsteking en celdood regulatie in autoinflammatoire ziekten en infecties

Preparatieve en analytische ultracentrifugatie ter ondersteuning van integratieve multi-omics studies.

Proteogenomics exploratie van de moleculaire mechanismen die aan de basis liggen van Salmonella infectie

Riboproteogenomics van de interactie tussen bacteriële pathogeen en zijn gastheer

Riboproteogenomics van het sORF-gecodeerde Salmonellapeptidoom

Translationele controle in infectiebiologie: de rol van sORFs in de pathogenese van Salmonella.

Een MALDI-8020 massaspectrometer voor analyse van peptiden en eiwitten.

Eiwit communicatie tijdens de ontwikkeling van arbusculaire mycorrhiza: het ontrafelen van de functie van tomatenworteleiwitten die interageren met schimmel effectoren

Het in kaart brengen van het tomatenproteïne-netwerk dat wordt geëxploiteerd door type III effectoren die betrokken zijn bij bacteriële verwelking

Het ontrafelen van de arbusculaire mycorrhiza-plant interface voor een verhoogde tomaten opbrengst bij drogere condities.

Identificatie van in planta gesecreteerde fungale effectoren en karakterisering van de tomaat proteinen waarmee ze interageren ter verbetering van arbusculaire mycorrhiza gebaseerde landbouw

Ontwikkeling van C-terminale peptidengebaseerde proteoomanalytische technologieën en de extensieve catalogering van granzyme protease substraten

BOF-ZAP-ambt in proteomica

Identificatie en karakterisering van de (virale) substraten van granzymes door gerichte, petidengebaseerde gelvrije proteoomanalyses