Een Nog Nuttiger Open Ecosysteem voor Gegevensuitwisseling in de Proteoomanalyse (ODEEPEU).

Geavanceerde AI-gedreven Bioinformatica Oplossingen voor Performante Peptidoomanalyse

Nieuwe kennis uit publieke gegevens in de de levenswetenschappen

Proteoom-gebaseerde epitopen voor sterk verbeterde ontwikkeling van antikanker en antibacteriële vaccins.

A Tale of Tissue and Text: Predictive proteome profiling and managing metadata mayhem

Bringing Confidence to Species Identifications: Probabilistic and Proteogenomic Approaches for Single Organism Samples and Metaproteomes

Doctoraatsproject Giulia Gonnelli

Doctoraatsproject Kenneth Verheggen

Doctoraatsproject Nicolas Housset

Doctoraatsproject Sule Yilmaz-Rumpf

Doctoraatsproject Surya Gupta

Een diaPASEF gedreven diepgaande computationele analyse in hete myotone dystrophie type 1 vloeibare biopsie proteoom

Innovatieve bio-informatica oplossingen om ion-networks om te vormen tot een sleutelrol in klinische toepassingen van de proteoomanalyse

Machine learning to the rescue: Enabling novel proteomics workflows with data-driven bioinformatics methods

Novel statistical strategies for differential PTM abundance analysis in proteomics

Proteoomanalyse van individuele cellen: van de details over ene enkele cel tot het ontrafelen van weefsels

Verbeterde machine leren-gebaseerde bioinformatica toepassingen om veel gevoeliger neo– en xeno-epitoop landschappen in kaart te brengen door middel van immunopeptidoom analyse.

Waar het allerkleinste van het grootste belang is: bio-informatica innovaties voor de proteoomanalyse van enkelvoudige microbiële cellen

Doctoraatsproject Elke Debrie

Doctoraatsproject Jeroen Gilis

Doctoraatsproject Niklaas Colaert

Doctoraatsproject Pieter Verschaffelt

Doctoraatsproject Stijn Vandenbulcke

Statistische methoden voor single cell proteomics

An geïntegreerd informatica-platform ter ondersteuning van gerichte massaspectrometrie

Bioinformatica : van nucleotiden tot netwerken ( N2N )

Computationele analyse en integratie van verscheidene Omics data

Contextafhankelijke identificatie van kinase-substraatassociatie en eiwitfosforylering door her-analyse op grote schaal van proteomics experimenten.

De eerste genoomwijde kaarten van het micropeptidoom gevalideerd door grootschalige heranalyse van publieke proteomics data

De grote metaproteomics identificatie-uitdaging aanpakken in hypercomplexe toepassingsdomeinen

Detectie en validatie van doelwitten voor farmaceutische interventie gebaseerd op de respons op cognitieve gedragstherapie bij myotone dystrofy type 1 patienten, op basis van geïntegreerde omics netwerken

Een computationeel raamwerk voor sensitieve en specifieke kwantitatieve metaproteomics

Een computationele aanpak voor sensitieve profilering van circulerende eiwitten uit weefsels

Een diaPASEF gedreven diepgaande computationele analyse in hete myotone dystrophie type 1 vloeibare biopsie proteoom

Een nieuw, datagedreven paradigma voor sensitive identificatie van phosphopeptides

Een nieuw tijdperk voor proteomics-gebaseerde proteïne PTM analyse met deep learning

Een studie van eiwit landschappen, hun toepassingen, en het garanderen van hun levensduur

Een vliegende start voor metaproteomics informatics

FoldMod: De rol van lokale aminozuurinteracties in het vouwen van eiwitten, de stabiliteit van de vouwing, en de locatie van post-translatie modificaties

FWO-ERA MBT-JTC Novofeed: Nieuwe ingrediënten in dierenvoeding uit duurzame bronnen.

FWO Sabbatical Martens Lennaert

Het online Tabloid Proteome: een uniek systeem om het eiwit-associatie netwerk bloot te leggen en te analyseren

MoDPA: Onderzoek naar ziekten via modificatie-afhankelijke eiwitassociaties

Nieuwe kennis uit publieke gegevens in de levenswetenschappen

Nieuwe kennis uit publieke gegevens in de levenswetenschappen.

Nieuwe statistische methodes voor betrouwbare kwantificatie van posttranslationele modificaties

Nieuwe statistische methodes voor betrouwbare kwantificatie van post-translationele modificaties

Orthogonale heranalyse van publieke proteoom en metaboloom gegevens om het volledige, metaboloom gebaseerde eiwitmodificatie landschap in kaart te brengen.

ProteinContour: de relatie tussen post-translationele modificaties, biofysische eigenschappen, interacties en sub-cellulaire locatie van eiwitten op proteoom niveau.

SPrInt: een nieuw platform voor de integratie van structurale proteomics data.

Unipept Next: een flexibelere, differentiële Unipept voor verwerking van multi-omics datasets

Verbeterde machine leren-gebaseerde bioinformatica toepassingen om veel gevoeliger neo– en xeno-epitoop landschappen in kaart te brengen door middel van immunopeptidoom analyse.

Een nieuwe rol voor Unipept: een framework voor comparatieve metaproteoomanalyses

Een nieuw fragment-gecentreerd perspectief op proteomics.

ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterken

Het zetten van AI in DIA – ontwikkelen van een ML-gedreven multi-modificatie zoek software

Proteeomgebaseerde en geïntegreerde analyse van de regulatie van de immuunrespons

Vergelijkende analyse van high-throughput metaproteoomdata in Unipept

Verzameling, verspreiding en analyse van multiscale celmigratiegegevens voor biologische en klinische toepassingen (MULTIMOT)

Een weg omheen de tekorten aan reagentia: een MS-gebaseerde test die focust op corona eiwit detectie.

Metabole fingerprinting voor diagnose en prognose van koemelkallergie in kinderen