Project

Orthogonale heranalyse van publieke proteoom en metaboloom gegevens om het volledige, metaboloom gebaseerde eiwitmodificatie landschap in kaart te brengen.

Code
bof/baf/4y/2024/01/794
Looptijd
01-01-2024 → 31-12-2025
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Bioinformatics data integration and network biology
    • Development of bioinformatics software, tools and databases
    • Structural bioinformatics and computational proteomics
    • Metabolomics
    • Proteomics
  • Medical and health sciences
    • Structural bioinformatics and computational proteomics
    • Medical metabolomics
    • Bioinformatics of disease
    • Medical metabolomics
Trefwoorden
eiwit analyse aritficiële intelligentie metaboloom analyse Eiwitveroudering massaspectrometrie
 
Projectomschrijving

Eiwitten zijn essentiële moleculen in onze cellen die cellulaire functies aansturen. Hun regulatie via chemische modificaties blijft echter grotendeels onbekend.

Daarom ondernemen we een uitgebreide mapping van het proteoom-brede modificatielandschap in vijf stappen:

  1. Uitbreiden van onze AI-modellen om massaspectrometrische gegevens in meer detail te interpreteren.

  2. Open modificatie identificaties uitvoeren op zeer grote datasets uit het publieke domein om eiwitmodificatie landschappen te bekomen.

  3. Bouw van modificatie-afhankelijke eiwitnetwerken op basis van deze modificatielandschappen.

  4. Een AI model ontwikkelen om ziektegerelateerde modificaties te ontdekken in deze landschappen.

  5. Al deze tools benutten om moleculaire veroudering in kaart te brengen, met focus op metabolisme-gelinkte modificaties.

Op deze manier kunnen we onze inzichten in het eiwitmodificatielandschap sterk verdiepen, wat kan leiden tot belangrijke doorbraken in zowel de celbiologie als de ziektebehandeling.