Deze studie onderzoekt de celtype specifieke rol van FOXG1, een neurologische transcriptiefactor die in verband wordt gebracht met verschillende neurologische aandoeningen, door middel van een geïntegreerde multi-methodologische aanpak. Eerst zullen we een innovatieve, niet-destructieve methode ontwikkelen om celtypes te identificeren in neurale organoïden op basis van fluorescentie lifetime imaging microscopie (FLIM) van autofluorescente FAD moleculen. Vervolgens zullen we FOXG1 lokaliseren tijdens de neuronale ontwikkeling op cellulair en intra-cellulair niveau en de interactiepartners en DNA-bindingsplaatsen bepalen. Verder zullen geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSCs) genetisch gemanipuleerd worden met CRISPR-Cas9 zodat ze verschillende FOXG1 afwijkingen bevatten. Op neurale organoïden gegenereerd van deze iPSCs, zal vervolgens niet-destructieve FLIM en single-cell RNA-sequencing uitgevoerd worden, wat ons in staat zal stellen om aangetaste celpopulaties en afwijkende gebeurtenissen op het transcriptoom niveau te identificeren. Tenslotte zal de studie het potentieel van kleine activerende RNA's onderzoeken om FOXG1 functieverlies in deze neurale organoïden om te keren. Kortom, deze studie zal ons begrip over de rol van FOXG1 in neurologische ontwikkeling en ziekte verdiepen, leiden tot een consistente mixed-method pijplijn voor organoïde analyse en bijdragen aan de ontwikkeling van nieuwe therapeutische benaderingen voor het FOXG1-syndroom.