Een embryo evolueert van een pluripotente groep van cellen naar een gedifferentieerd organisme. Deze overgang van pluripotentie naar differentiatie wordt gestuurd door bepaalde transcriptiefactoren zoals OCT4 en NANOG. Ook signaalmoleculen hebben hierop een invloed, evenals epigenetische factoren. Door middel van transcriptoom-, epigenoom- en proteoomanalysen bij embryo’s en embryonale stamcellen zal het complexe samenspel van deze factoren ontrafeld worden.