Project

Ontwikkeling van een forward genetic screen platform voor diatomeeën op basis van mitotische recombinatie

Code
01D08921
Looptijd
01-11-2021 → 30-09-2024
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Other organic elements and compounds
    • Analysis of next-generation sequence data
    • Microbiology not elsewhere classified
    • Genetics
  • Engineering and technology
    • Algae biotechnology
Trefwoorden
diatomeeën voorwaarts genetisch scherm biobased economy
 
Projectomschrijving

Diatomeeën zijn een soortenrijke groep van microalgen met diverse metabole capaciteiten en een enorm potentieel aan biotechnologische toepassingen, waaronder de productie van biobrandstoffen, voedingsstoffen en verschillende heterologe moleculen. De functie van een groot deel van de diatomeeëngenen blijft evenwel onbekend hoewel dit vele nieuwe diatomee-gebaseerde applicaties zou ontgrendelen. Onlangs hebben we ontdekt dat diatomeeën hoge mitotische recombinatiesnelheden vertonen tussen homologe chromosomen, resulterend in een verlies van heterozygositeit. In dit project wensen we dit merkwaardige fenomeen te gebruiken voor de ontwikkeling van een forward genetic screen platform, inclusief het opzetten en de optimalisatie van de beste screeningomstandigheden, alsook de ontwikkeling van een bio- informaticapijplijn om oorzakelijke mutaties te identificeren. Als proof of concept zullen we het ontwikkelde platform gebruiken om genen te identificeren die betrokken zijn bij de biosynthese van carotenoïden.