Project

Detectie van genen met geconserveerde functies door middel van vergelijkend transcriptoom onderzoek in planten

Code
3G001015
Looptijd
01-01-2015 → 31-12-2020
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Scientific computing
    • Bioinformatics and computational biology
    • Plant biology
  • Medical and health sciences
    • Bioinformatics and computational biology
    • Bioinformatics and computational biology
    • Public health care
    • Public health services
    • Bioinformatics and computational biology
  • Engineering and technology
    • Biomaterials engineering
    • Biological system engineering
    • Biomaterials engineering
    • Biomechanical engineering
    • Other (bio)medical engineering
    • Environmental engineering and biotechnology
    • Industrial biotechnology
    • Other biotechnology, bio-engineering and biosystem engineering
    • Scientific computing
Trefwoorden
gene ontology orthologie alternatieve splicing RNA-Seq functie predictie comparative transcriptomics
 
Projectomschrijving

Nieuwe methoden zullen ontwikkeld worden om functies van genen en transcripten te voorspellen. Deze methoden zullen robuust functies transfereren tussen coexpresserende transcripten en zullen orthologen met geconserveerde coexpressiecontext detecteren. Dit laat toe om kwaliteitsvolle voorspellingen te maken voor transcripten, zelfs voor species met weinig gekende experimentele functies of met een verre evolutionaire afstand tot een modelorganisme.