Project

De ontwikkeling van een kostenefficiënte eQTL detectie methode om de brede transcriptionele respons van een generalistische plaag op nieuwe waardplanten te ontrafelen

Code
01CD17423
Looptijd
14-04-2024 → 13-10-2024
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Analysis of next-generation sequence data
  • Medical and health sciences
    • Computational transcriptomics and epigenomics
  • Agricultural and food sciences
    • Agricultural plant protection
Trefwoorden
waardplant adaptatie genotype-omgevingsinteracties Tetranychus urticae eQTL scanning
 
Projectomschrijving
Om het unieke adaptatievermogen van de polyfage bonenspintmijt aan nieuwe waardplanten, en onderliggende genetische mechanismen te ontrafelen, werd een ‘pseudo-panmictische’ populatie gecreëerd om: (i) eQTLs (voornamelijk trans), gelinkt aan een waardplant verandering, te detecteren op basis van RNA-seq (ii) Genotype-omgevingsinteracties te analyseren in verschillende waardplanten (iii) Genetische selectie door een nieuwe waardplant voor/tegen relevante genotypes geïdentificeerd in (i) en (ii) te bestuderen