Project

Identificatie van eiwitten betrokken bij lignificatie door middel van foto-affiniteit labeling.

Code
3G008116
Looptijd
01-01-2016 → 31-12-2019
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Scientific computing
    • Bioinformatics and computational biology
  • Medical and health sciences
    • Bioinformatics and computational biology
    • Bioinformatics and computational biology
    • Public health care
    • Public health services
    • Bioinformatics and computational biology
  • Engineering and technology
    • Scientific computing
Trefwoorden
Proteïnen foto-affiniteit lignificatie
 
Projectomschrijving

Planten vormen de hoeksteen van de bio-based economy als ze zonne-energie kan omzetten in organische verbindingen. De polysacchariden in de celwand kan enzymatisch worden omgezet in suikers die kunnen worden gefermenteerd in een overvloed aan producten. Dit proces is grotendeels gehinderd door lignine, een aromatische heteropolymeercomplex dat het polysaccharide matrix omvat. Verlagen ligninegehalte of wijziging van de samenstelling kan de afgifte van suikers uit plantaardige biomassa te stimuleren. Anderzijds, lignine is een waardevol polymeer als het leadmolecules kan voorzien in een groot aantal chemicaliën die tegenwoordig uit fossiele bronnen. De belangrijkste beperkende factor exploiteren of lignine voorkomen is het gebrek aan informatie en inzicht lignification sturen in een bepaalde gewenste richting. Dit project richt zich op het vergroten van de fundamentele kennis op lignification met behulp van foto-affiniteit gelabeld eiwit zuivering, een krachtige techniek die de klassieke benadering die wordt toegepast om nieuwe spelers te detecteren in biochemische routes aanvult. Voor deze benadering worden synthetische fotoactieve monolignols gebruikt die covalent kunnen binden aan de actieve plaatsen van eiwitten. Na kruiskoppeling verbinding tezamen worden gezuiverd met interagerende eiwitten. Een subset van veelbelovende treffers zal verder worden onderzocht met behulp van een reverse genetische benadering. Deze uitdagende project steunt op de sterke samenwerking tussen partners met verschillende expertise en moeten ons begrip van lignification uit te breiden.