Het project heeft tot doel om door middel van vergelijkende studies van volledige bacteriële genoomsequenties voor een aantal groepen van bacteriën die behoren tot verschillende fylogenetische takken, breed toepasbare sets van genen en primers te identificeren die kunne gebruikt worden om multilocus sequentieanalyse (MLSA) als een nieuwe sleuteltechniek voor de afbakening van soorten te ontwikkelen. Het einddoel is om een generisch methodologie te ontwikkelen voor de algemene MLSA-gesteunde beschrijving van bacteriële species.