Research Explorer

Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.

Onderzoeker

Thomas Depuydt

Publicaties & datasets

Prijzen & Erkenningen

9 Resultaten

2026

MINI-EX version 2 : cell-type-specific gene regulatory network inference using an integrative single-cell transcriptomics approach

Jasper StautNicolás Manosalva PérezThomas DepuydtKlaas VandepoeleSvitlana Lukicheva

Hoofdstuk in een boek in Plant transcription factors : methods and protocols

2024

MINI‐AC : inference of plant gene regulatory networks using bulk or single‐cell accessible chromatin profiles

Nicolás Manosalva PérezCamilla FerrariJulia EngelhornThomas DepuydtHilde NelissenThomas HartwigKlaas Vandepoele

A1 Artikel in een tijdschrift in PLANT JOURNAL

2023

A redundant transcription factor network steers spatiotemporal Arabidopsis triterpene synthesis

Trang Hieu NguyenLouis ThiersAlex Van MoerkerckeYuechen BaiPatricia Fernandez CalvoMax MinneThomas DepuydtMaite Colinas MartinezKevin VerstaenGert Van Isterdael et al.

A1 Artikel in een tijdschrift in NATURE PLANTS

Charting arabidopsis gene functions from multi-omics and single-cell data

Thomas DepuydtKlaas Vandepoele

Charting plant gene functions in the multi-omics and single-cell era

Thomas DepuydtBert De RybelKlaas Vandepoele

A1 Artikel in een tijdschrift in TRENDS IN PLANT SCIENCE

Plant lineage-specific PIKMIN1 drives APC/CCCS52A2 E3-ligase activity-dependent cell division

Alex WillemsYuanke LiangJefri HeymanThomas DepuydtThomas EekhoutBalkan CanherHilde Van Den DaeleIlse VercauterenKlaas VandepoeleLieven De Veylder

A1 Artikel in een tijdschrift in PLANT PHYSIOLOGY

Transcription factors KANADI 1, MYB DOMAIN PROTEIN 44, and PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR 4 regulate long intergenic noncoding RNAs expressed in Arabidopsis roots

Li LiuMichel HeideckerThomas DepuydtNicolás Manosalva PérezMartin CrespiThomas BleinKlaas Vandepoele

A1 Artikel in een tijdschrift in PLANT PHYSIOLOGY

2021

Multi‐omics network‐based functional annotation of unknown Arabidopsis genes

Thomas DepuydtKlaas Vandepoele

A1 Artikel in een tijdschrift in PLANT JOURNAL

2020

Comprehensive and functional analysis of horizontal gene transfer events in diatoms

Emmelien VancaesterThomas DepuydtCristina OsunaKlaas Vandepoele

A1 Artikel in een tijdschrift in MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION