Instellingen beheren
MENU
Over deze site
In English
Home
Onderzoekers
Projecten
Organisaties
Publicaties
Infrastructuur
Contact
Research Explorer
Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.
Onderzoeker
Simon Daled
Profiel
Projecten
Publicaties
Activiteiten
Prijzen & Erkenningen
23
Resultaten
2025
Classification of collagens via peptide ambiguation, in a paleoproteomic LC-MS/MS-based taxonomic pipeline
Ian Engels
Alexandra Burnett
Prudence Robert
Camille Pironneau
Grégory Abrams
Robbin Bouwmeester
Peter Van Der Plaetsen
Kévin Di Modica
Marcel Otte
Lawrence Guy Straus
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2025
2023
First insights into human mobility in Neolithic Belgium using strontium isotopic analysis and proteomics : a case study of Grotte de La Faucille (Sclayn, province of Namur)
IJk van Hattum
Marta Costas Rodriguez
Kasper Hobin
Frank Vanhaecke
Hans Vandendriessche
Hélène Collet
Pierre Cattelain
Michel Toussaint
Quentin Goffette
Maarten Dhaenens
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
AMERICAN JOURNAL OF BIOLOGICAL ANTHROPOLOGY
2023
2022
A comprehensive LFQ benchmark dataset on modern day acquisition strategies in proteomics
Bart Van Puyvelde
Simon Daled
Sander Willems
Ralf Gabriels
Anne Gonzalez de Peredo
Karima Chaoui
Emmanuelle Mouton-Barbosa
David Bouyssié
Kurt Boonen
Christopher J. Hughes
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC DATA
2022
A large scale mass spectrometry-based histone screening for assessing epigenetic developmental toxicity
Sigrid Verhelst
Bart Van Puyvelde
Sander Willems
Simon Daled
Senne Cornelis
Laura Corveleyn
Ewoud Willems
Dieter Deforce
Laura De Clerck
Maarten Dhaenens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2022
An interactive mass spectrometry atlas of histone posttranslational modifications in T-cell acute leukemia
Lien Provez
Bart Van Puyvelde
Laura Corveleyn
Nina Demeulemeester
Sigrid Verhelst
Beatrice Lintermans
Simon Daled
Juliette Roels
Lieven Clement
Lennart Martens
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC DATA
2022
Analyzing data independent acquisition mass spectrometry with noiseless ion-networks
Sander Willems
Simon Daled
Bart Van Puyvelde
Laura De Clerck
Sofie Vande Casteele
Filip Van Nieuwerburgh
Dieter Deforce
Maarten Dhaenens
Preprint
2022
Collaborative science : from proteomics method development to core facility
Simon Daled
Dieter Deforce
Maarten Dhaenens
Proefschrift
2022
Proteomic comparison of three wild-type pseudorabies virus strains and the attenuated bartha strain reveals reduced incorporation of several tegument proteins in bartha virions
Jonas Delva
Simon Daled
Cliff Van Waesberghe
Ruben Almey
Robert J. J. Jansens
Dieter Deforce
Maarten Dhaenens
Herman Favoreel
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF VIROLOGY
2022
2021
An experimental design to extract more information from MS-based histone studies
Laura De Clerck
Sander Willems
Simon Daled
Bart Van Puyvelde
Sigrid Verhelst
Laura Corveleyn
Dieter Deforce
Maarten Dhaenens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR OMICS
2021
Cov-MS : a community-based template assay for mass-spectrometry-based protein detection in SARS-CoV-2 patients
Bart Van Puyvelde
Katleen Van Uytfanghe
Olivier Tytgat
Laurence Van Oudenhove
Ralf Gabriels
Robbin Bouwmeester
Simon Daled
Tim Van Den Bossche
Pathmanaban Ramasamy
Sigrid Verhelst
et al.
A2
Artikel in een tijdschrift
in
JACS AU
2021
Histone sample preparation for bottom-up mass spectrometry : a roadmap to informed decisions
Simon Daled
Sander Willems
Bart Van Puyvelde
Laura Corveleyn
Sigrid Verhelst
Laura De Clerck
Dieter Deforce
Maarten Dhaenens
A2
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMES
2021
Large scale toxicoepigenetics on histones : a mass spectrometry-based screening assay applied to developmental toxicity
Sigrid Verhelst
Bart Van Puyvelde
Sander Willems
Simon Daled
Senne Cornelis
Laura Corveleyn
Ewoud Willems
Dieter Deforce
Laura De Clerck
Maarten Dhaenens
Preprint
2021
The CD147 protein complex is involved in entry of Chikungunya virus and related alphaviruses in human cells
Lien De Caluwe
Sandra Coppens
Katleen Vereecken
Simon Daled
Maarten Dhaenens
Xaveer Van Ostade
Dieter Deforce
Kevin K. Arien
Koen Bartholomeeusen
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
2021
2020
An alphaherpesvirus exploits antimicrobial beta-defensins to initiate respiratory tract infection
Jolien Van Cleemput
Katrien Poelaert
Kathlyn Laval
Nathalie Vanderheijden
Maarten Dhaenens
Simon Daled
Filip Boyen
Frank Pasmans
Hans Nauwynck
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF VIROLOGY
2020
Comprehensive histone epigenetics : a mass spectrometry based screening assay to measure epigenetic toxicity
Sigrid Verhelst
Laura De Clerck
Sander Willems
Bart Van Puyvelde
Simon Daled
Dieter Deforce
Maarten Dhaenens
A2
Artikel in een tijdschrift
in
METHODSX
2020
Removing the hidden data dependency of DIA with predicted spectral libraries
Bart Van Puyvelde
Sander Willems
Ralf Gabriels
Simon Daled
Laura De Clerck
Sofie Vande Casteele
An Staes
Francis Impens
Dieter Deforce
Lennart Martens
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2020
2019
Host intestinal biomarker identification in a gut leakage model in broilers
Fien De Meyer
Venessa Eeckhaut
Richard Ducatelle
Maarten Dhaenens
Simon Daled
Annelike Dedeurwaerder
Maarten De Gussem
Freddy Haesebrouck
Dieter Deforce
Filip Van Immerseel
A1
Artikel in een tijdschrift
in
VETERINARY RESEARCH
2019
Host metabolites stimulate the bacterial proton motive force to enhance the activity of aminoglycoside antibiotics
Aurélie Crabbé
Lisa Ostyn
Sorien Staelens
Charlotte Rigauts
Martijn Risseeuw
Maarten Dhaenens
Simon Daled
Heleen Van Acker
Dieter Deforce
Serge Van Calenbergh
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS PATHOGENS
2019
Small RNA NcS27 co-regulates utilization of carbon sources in Burkholderia cenocepacia J2315
Andrea Sass
Stijn De Waele
Simon Daled
Bart Devreese
Dieter Deforce
Filip Van Nieuwerburgh
Tom Coenye
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIOLOGY-SGM
2019
The role of small proteins in Burkholderia cenocepacia J2315 biofilm formation, persistence and intracellular growth
Heleen Van Acker
Aurélie Crabbé
Dukas Jurėnas
Lisa Ostyn
Andrea Sass
Simon Daled
Maarten Dhaenens
Dieter Deforce
Eline Teirlinck
Herlinde De Keersmaecker
et al.
A2
Artikel in een tijdschrift
in
BIOFILM
2019
hSWATH : unlocking SWATH’s full potential for an untargeted histone perspective
Laura De Clerck
Sander Willems
Roberta Noberini
Camilla Restellini
Bart Van Puyvelde
Simon Daled
Tiziana Bonaldi
Dieter Deforce
Maarten Dhaenens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2019
2018
Microfluidics-based liquid chromatography/mass spectrometry multiple reaction monitoring approach for the relative quantification of Burkholderia cenocepacia secreted virulence factors
Sofie Depluverez
Simon Daled
Stijn De Waele
Sören Planckaert
Jolien Schoovaerts
Dieter Deforce
Bart Devreese
A1
Artikel in een tijdschrift
in
RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY
2018
2016
Assessing the impact of minimizing arginine conversion in fully defined SILAC culture medium in human embryonic stem cells
Ellen Scheerlinck
Katleen Van Steendam
Simon Daled
Elisabeth Govaert
Liesbeth Vossaert
Paulien Meert
Filip Van Nieuwerburgh
Ann Van Soom
Luc Peelman
Petra De Sutter
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2016