Instellingen beheren
MENU
Over deze site
In English
Home
Onderzoekers
Projecten
Organisaties
Publicaties
Infrastructuur
Contact
Research Explorer
Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.
Onderzoeker
Niklaas Colaert
Profiel
Projecten
Publicaties
Activiteiten
Prijzen & Erkenningen
27
Resultaten
2015
The iceLogo web server and SOAP service for determining protein consensus sequences
Davy Maddelein
Niklaas Colaert
Iain Buchanan
Niels Hulstaert
Kris Gevaert
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2015
2013
PiTRAQ, a strategy to simultaneously correlate protein expression and phosphorylation stoichiometry between different samples: evaluation on different mass spectrometers
Pieter Glibert
Maarten Dhaenens
Paulien Meert
Niklaas Colaert
Filip Van Nieuwerburgh
Lennart Martens
Dieter Deforce
C3
Conferentie
2013
The Online Protein Processing Resource (TOPPR) : a database and analysis platform for protein processing events
Niklaas Colaert
Davy Maddelein
Francis Impens
Petra Van Damme
Kim Plasman
Kenny Helsens
Niels Hulstaert
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2013
2012
Cells lacking β-actin are genetically reprogrammed and maintain conditional migratory capacity
Davina Tondeleir
Anja Lambrechts
Matthias Müller
Veronique Jonckheere
Thierry Doll
Drieke Vandamme
Karima Bakkali
DAVY WATERSCHOOT
Marianne Lemaistre
Olivier Debeir
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2012
Evaluation of a strategy for parallel protein phosphorylation and expression analysis
Pieter Glibert
Maarten Dhaenens
Paulien Meert
Niklaas Colaert
Filip Van Nieuwerburgh
Lennart Martens
Dieter Deforce
C3
Conferentie
2012
Proteome profiling of the green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum by N-terminal proteomics
Kalliopi Kouyianou
Pieter-Jan De Bock
Niklaas Colaert
Antigoni Nikolaki
Aikaterini Aktoudianaki
Kris Gevaert
Georgios Tsiotis
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2012
2011
A case study on the comparison of different software tools for automated quantification of peptides
Niklaas Colaert
Joël Vandekerckhove
Lennart Martens
Kris Gevaert
Hoofdstuk in een boek
in
Gel-free proteomics : methods and protocols
2011
A comparison of MS2-based label-free quantitative proteomic techniques with regards to accuracy and precision
Niklaas Colaert
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2011
A reproducibility-based evaluation procedure for quantifying the differences between MS/MS peak intensity normalization methods
Sven Degroeve
Niklaas Colaert
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2011
Analysis of the resolution limitations of peptide identification algorithms
Niklaas Colaert
Sven Degroeve
Kenny Helsens
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2011
Combining quantitative proteomics data processing workflows for greater sensitivity
Niklaas Colaert
Christophe Van Huele
Sven Degroeve
An Staes
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE METHODS
2011
Digging deeper in the data, novel approaches and analysis methods in quantitative peptide-centric proteomics
Niklaas Colaert
Kris Gevaert
Lennart Martens
Proefschrift
2011
N-Terminal combined fractional diagonal chromatographic (COFRADIC) analysis of the human platelet proteome
Francis Impens
Kenny Helsens
Niklaas Colaert
Lennart Martens
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
Hoofdstuk in een boek
in
Platelet proteomics : principles, analysis, and applications
2011
RIBAR and xRIBAR: methods for reproducible relative MS/MS-based label-free protein quantification
Niklaas Colaert
Kris Gevaert
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2011
Redox proteomics of protein-bound methionine oxidation
Bart Ghesquière
Veronique Jonckheere
Niklaas Colaert
Joost Van Durme
Evy Timmerman
Marc Goethals
Joost Schymkowitz
Frederic Rousseau
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2011
compomics-utilities: an open-source Java library for computational proteomics
Harald Barsnes
Marc Vaudel
Niklaas Colaert
Kenny Helsens
Albert Sickmann
Frode S Berven
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC BIOINFORMATICS
2011
thermo-msf-parser: an open source Java library to parse and visualize Thermo Proteome Discoverer msf files
Niklaas Colaert
Harald Barsnes
Marc Vaudel
Kenny Helsens
Evy Timmerman
Albert Sickmann
Kris Gevaert
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2011
2010
A quantitative proteomics design for systematic identification of protease cleavage events
Francis Impens
Niklaas Colaert
Kenny Helsens
Bart Ghesquière
Evy Timmerman
Pieter-Jan De Bock
Benjamin M Chain
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2010
Complementary positional proteomics for screening substrates of endo- and exoproteases
Petra Van Damme
An Staes
Silvia Bronsoms
Kenny Helsens
Niklaas Colaert
Evy Timmerman
Francesc X Aviles
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE METHODS
2010
MS-driven protease substrate degradomics
Francis Impens
Niklaas Colaert
Kenny Helsens
Kim Plasman
Petra Van Damme
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2010
Rover: a tool to visualize and validate quantitative proteomics data from different sources
Niklaas Colaert
Kenny Helsens
Francis Impens
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2010
The substrate specificity profile of human granzyme A
Petra Van Damme
Sebastian Maurer-Stroh
Han Hao
Niklaas Colaert
Evy Timmerman
Frank Eisenhaber
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOLOGICAL CHEMISTRY
2010
ms_lims, a simple yet powerful open source laboratory information management system for MS-driven proteomics
Kenny Helsens
Niklaas Colaert
Harald Barsnes
Thilo Muth
Kristian Flikka
An Staes
Evy Timmerman
Steffi Wortelkamp
Albert Sickmann
Joël Vandekerckhove
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2010
2009
Analysis of Protein Processing by N-terminal Proteomics Reveals Novel Species-specific Substrate Determinants of Granzyme B Orthologs
Petra Van Damme
Sebastian Maurer-Stroh
Kim Plasman
Joost Van Durme
Niklaas Colaert
Evy Timmerman
Pieter-Jan De Bock
Marc Goethals
Frederic Rousseau
Joost Schymkowitz
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2009
Improved visualization of protein consensus sequences by iceLogo
Niklaas Colaert
Kenny Helsens
Lennart Martens
Joël Vandekerckhove
Kris Gevaert
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE METHODS
2009
In vitro and in vivo protein-bound tyrosine nitration characterized by diagonal chromatography
Bart Ghesquière
Niklaas Colaert
Kenny Helsens
Lien Dejager
Caroline Vanhaute
Katleen Verleysen
Koen Kas
Evy Timmerman
Marc Goethals
Claude Libert
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2009
Proteomics analyses reveal the evolutionary conservation and divergence of N-terminal acetyltransferases from yeast and humans
Thomas Arnesen
Petra Van Damme
Bogdan Polevoda
Kenny Helsens
Rune Evjenth
Niklaas Colaert
Jan Erik Varhaug
Joël Vandekerckhove
Johan Lillehaug
Fred Sherman
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
2009