Instellingen beheren
MENU
Over deze site
In English
Home
Onderzoekers
Projecten
Organisaties
Publicaties
Infrastructuur
Contact
Research Explorer
Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.
Onderzoeker
Kevin Vanneste
Profiel
Projecten
Publicaties
Activiteiten
Prijzen & Erkenningen
29
Resultaten
2023
Development of a portable on-site applicable metagenomic data generation workflow for enhanced pathogen and antimicrobial resistance surveillance
Bram Bloemen
Mathieu Gand
Kevin Vanneste
Kathleen Marchal
Nancy H. C. Roosens
Sigrid C. J. De Keersmaecker
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2023
Transforming Shiga toxin-producing Escherichia coli surveillance through whole genome sequencing in food safety practices
Stéphanie Nouws
Bavo Verhaegen
Sarah Denayer
Florence Crombé
Denis Piérard
Bert Bogaerts
Kevin Vanneste
Kathleen Marchal
Nancy H. C. Roosens
Sigrid C. J. De Keersmaecker
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
2023
2022
Metagenomics to detect and characterize viruses in food samples at genome level? Lessons learnt from a norovirus study
Florence Buytaers
Bavo Verhaegen
Mathieu Gand
Jolien D'aes
Kevin Vanneste
Nancy H. C. Roosens
Kathleen Marchal
Sarah Denayer
Sigrid C. J. De Keersmaecker
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FOODS
2022
2021
Application of a strain- level shotgun metagenomics approach on food samples : resolution of the source of a Salmonella food-borne outbreak
Florence Buytaers
Assia Saltykova
Wesley Mattheus
Valeska Laisnez
Bavo Verhaegen
Nancy H. C. Roosens
Kevin Vanneste
Naiima Hammami
Brigitte Pochet
Vera Cantaert
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIAL GENOMICS
2021
Case report : multidrug resistant Raoultella ornithinolytica in a septicemic calf
Mathilde Pas
Kevin Vanneste
Jade Bokma
Laura Van Driessche
Sigrid C. J. De Keersmaecker
Nancy H. Roosens
Freddy Haesebrouck
Filip Boyen
Bart Pardon
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FRONTIERS IN VETERINARY SCIENCE
2021
Evaluation of WGS performance for bacterial pathogen characterization with the Illumina technology optimized for time-critical situations
Bert Bogaerts
Raf Winand
Julien Van Braekel
Stefan Hoffman
Nancy H. C. Roosens
Sigrid C. J. De Keersmaecker
Kathleen Marchal
Kevin Vanneste
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIAL GENOMICS
2021
Retrospective evaluation of routine whole genome sequencing of Mycobacterium tuberculosis at the Belgian National Reference Center, 2019
Karine Soetaert
Pieter-Jan Ceyssens
Samira Boarbi
Bert Bogaerts
Thomas Delcourt
Kevin Vanneste
Sigrid C.J. De Keersmaecker
Nancy H.C. Roosens
Alexandra Vodolazkaia
Marina Mukovnikova
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ACTA CLINICA BELGICA
2021
Towards real-time and affordable strain-level metagenomics-based foodborne outbreak investigations using Oxford nanopore sequencing technologies
Florence Buytaers
Assia Saltykova
Sarah Denayer
Bavo Verhaegen
Kevin Vanneste
Nancy H. C. Roosens
Denis Pierard
Kathleen Marchal
Sigrid C. J. De Keersmaecker
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
2021
Whole genome sequencing provides an added value to the investigation of staphylococcal food poisoning outbreaks
Stéphanie Nouws
Bert Bogaerts
Bavo Verhaegen
Sarah Denayer
Lasse Laeremans
Kathleen Marchal
Nancy H. C. Roosens
Kevin Vanneste
Sigrid C. J. De Keersmaecker
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
2021
Whole-genome sequencing-based antimicrobial resistance characterization and phylogenomic investigation of 19 multidrug-resistant and extended-spectrum beta-lactamase-positive escherichia coli strains collected from hospital patients in Benin in 2019
Carine Laurence Yehouenou
Bert Bogaerts
Sigrid C. J. De Keersmaecker
Nancy H. C. Roosens
Kathleen Marchal
Edmond Tchiakpe
Dissou Affolabi
Anne Simon
Francis Moise Dossou
Kevin Vanneste
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
2021
2020
Development of an NGS-based workflow for improved monitoring of circulating plasmids in support of risk assessment of antimicrobial resistance gene dissemination
Bas Berbers
Pieter-Jan Ceyssens
Pierre Bogaerts
Kevin Vanneste
Nancy Roosens
Kathleen Marchal
Sigrid C.J. De Keersmaecker
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ANTIBIOTICS-BASEL
2020
First detection of a plasmid located carbapenem resistant bla(VIM-1) gene in E. coli isolated from meat products at retail in Belgium in 2015
Cristina Garcia-Graells
Bas Berbers
Bavo Verhaegen
Kevin Vanneste
Kathleen Marchal
Nancy H. C. Roosens
Nadine Botteldoorn
Sigrid C. J. De Keersmaecker
A1
Artikel in een tijdschrift
in
INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD MICROBIOLOGY
2020
Impact of DNA extraction on whole genome sequencing analysis for characterization and relatedness of Shiga toxin-producing Escherichia coli isolates
Stephanie Nouws
Bert Bogaerts
Bavo Verhaegen
Sarah Denayer
Denis Pierard
Kathleen Marchal
Nancy H. C. Roosens
Kevin Vanneste
Sigrid C. J. De Keersmaecker
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2020
2017
Isolation of the highly pathogenic and zoonotic agent Burkholderia pseudomallei from a pet green iguana (Iguana iguana) in Belgium
Tom Hellebuyck
Pierre Wattiau
Filip Boyen
Ilse Moeremans
Nancy Roossens
Kevin Vanneste
An Garmyn
Veronique Saey
Frank Pasmans
Freddy Haesebrouck
C3
Conferentie
2017
Revisiting ancestral polyploidy in plants
Colin Ruprecht
Rolf Lohaus
Kevin Vanneste
Marek Mutwil
Zoran Nikoloski
Yves Van de Peer
Staffan Persson
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENCE ADVANCES
2017
2016
The genome of the seagrass Zostera marina reveals angiosperm adaptation to the sea
Jeanine L Olsen
Pierre Rouzé
Bram Verhelst
Yao-Cheng Lin
Till Bayer
Jonas Collen
Emanuela Dattolo
Emanuele De Paoli
Simon Dittami
Florian Maumus
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE
2016
2015
Horsetails are ancient polyploids : evidence from Equisetum giganteum
Kevin Vanneste
Lieven Sterck
Alexander Andrew Myburg
Yves Van de Peer
Eshchar Mizrachi
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT CELL
2015
The genome sequence of the orchid Phalaenopsis equestris
Jing Cai
Xin Liu
Kevin Vanneste
Sebastian Proost
Wen-Chieh Tsai
Ke-Wei Liu
Li-Jun Chen
Ying He
Qing Xu
Chao Bian
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE GENETICS
2015
2014
Analysis of 41 plant genomes supports a wave of successful genome duplications in association with the Cretaceous-Paleogene boundary
Kevin Vanneste
Guy Baele
Steven Maere
Yves Van de Peer
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME RESEARCH
2014
Tangled up in two: a burst of genome duplications at the end of the Cretaceous and the consequences for plant evolution
Kevin Vanneste
Steven Maere
Yves Van de Peer
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES
2014
The TPLATE adaptor complex drives clathrin-mediated endocytosis in plants
Astrid Gadeyne
Clara Sánchez-Rodríguez
Steffen Vanneste
Simone Di Rubbo
Henrik Zauber
Kevin Vanneste
Jelle Van Leene
Nancy De Winne
Dominique Eeckhout
Geert Persiau
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CELL
2014
The evolutionary significance of gene and genome duplications
Kevin Vanneste
Yves Van de Peer
Steven Maere
Proefschrift
2014
The genome of Eucalyptus grandis
Alexander A Myburg
Dario Grattapaglia
Gerald A Tuskan
Uffe Hellsten
Richard D Hayes
Jane Grimwood
Jerry Jenkins
Erika Lindquist
Hope Tice
Diane Bauer
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE
2014
2013
Inference of genome duplications from age distributions revisited
Kevin Vanneste
Yves Van de Peer
Steven Maere
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION
2013
Recombinant antibody production in Arabidopsis seeds triggers an unfolded protein response
Kirsten De Wilde
Sylvie De Buck
Kevin Vanneste
Anna Depicker
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2013
The Norway spruce genome sequence and conifer genome evolution
Björn Nystedt
Nathaniel R Street
Anna Wetterbom
Andrea Zuccolo
Yao-Cheng Lin
Douglas G Scofield
Francesco Vezzi
Nicolas Delhomme
Stefania Giacomello
Andrey Alexeyenko
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE
2013
2012
Expansive evolution of the TREHALOSE-6-PHOSPHATE PHOSPHATASE gene family in Arabidopsis
Lies Vandesteene
Lorena Lopez Galvis
Kevin Vanneste
Regina Feil
Steven Maere
Willem Lammens
Filip Rolland
John E Lunn
Nelson Avonce
Tom Beeckman
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2012
Gamma paleohexaploidy in the stem lineage of core eudicots: significance for MADS-box gene and species diversification
Dries Vekemans
Sebastian Proost
Kevin Vanneste
Heleen Coenen
Tom Viaene
Philip Ruelens
Steven Maere
Yves Van de Peer
Koen Geuten
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION
2012
Reconstruction of ancestral metabolic enzymes reveals molecular mechanisms underlying evolutionary innovation through gene duplication
Karin Voordeckers
Chris A. Brown
Kevin Vanneste
Elisa van der Zande
Arnout Voet
Steven Maere
Kevin J. Verstrepen
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS BIOLOGY
2012