Instellingen beheren
MENU
Over deze site
In English
Home
Onderzoekers
Projecten
Organisaties
Publicaties
Infrastructuur
Contact
Research Explorer
Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.
Onderzoeker
Elien Vandermarliere
Profiel
Projecten
Publicaties
Activiteiten
Prijzen & Erkenningen
29
Resultaten
2022
Sensitive and specific spectral library searching with CompOmics Spectral library Searching tool and Percolator
Genet Abay Shiferaw
Ralf Gabriels
Robbin Bouwmeester
Tim Van Den Bossche
Elien Vandermarliere
Lennart Martens
Pieter-Jan Volders
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2022
2021
Massively parallel interrogation of protein fragment secretability using SECRiFY reveals features influencing secretory system transit
Morgane Boone
Pathmanaban Ramasamy
Jasper Zuallaert
Robbin Bouwmeester
Berre Van Moer
Davy Maddelein
Demet Turan
Niels Hulstaert
Hannah Eeckhaut
Elien Vandermarliere
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE COMMUNICATIONS
2021
2020
COSS : a fast and user-friendly tool for spectral library searching
Genet Abay Shiferaw
Elien Vandermarliere
Niels Hulstaert
Ralf Gabriels
Lennart Martens
Pieter-Jan Volders
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2020
Scop3P : a comprehensive resource of human phosphosites within their full context
Pathmanaban Ramasamy
Demet Turan
Natalia Tichshenko
Niels Hulstaert
Elien Vandermarliere
Wim Vranken
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2020
The CEP5 peptide promotes abiotic stress tolerance, as revealed by quantitative proteomics, and attenuates the AUX/IAA equilibrium in Arabidopsis
Stephanie Smith
Shanshuo Zhu
Lisa Joos
Ianto Roberts
Natalia Nikonorova
Lam Dai Vu
Elisabeth Stes
Hyunwoo Cho
Antoine Larrieu
Wei Xuan
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2020
2019
Keeping up appearances in the mumps vaccine : do antigenic differences matter?
Tessa Vermeire
Lennart Martens
Steven Van Gucht
Paul Rota
Elien Vandermarliere
Proefschrift
2019
2018
Cross-linked peptide identification : a computational forest of algorithms
Sule Yilmaz-Rumpf
Genet Abay Shiferaw
Josep Rayo
Anastassios Economou
Lennart Martens
Elien Vandermarliere
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MASS SPECTROMETRY REVIEWS
2018
Differences in antigenic sites and other functional regions between genotype A and G mumps virus surface proteins
Sigrid Gouma
Tessa Vermeire
Steven Van Gucht
Lennart Martens
Veronik Hutse
Jeroen Cremer
Paul A Rota
Geert Leroux-Roels
Marion Koopmans
Rob van Binnendijk
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2018
The mutational landscape of MYCN, Lin28b and ALKF1174L driven murine neuroblastoma mimics human disease
Bram De Wilde
Anneleen Beckers
Sven Lindner
Kristina Althoff
Katleen De Preter
Pauline Depuydt
Pieter Mestdagh
Tom Sante
Steve Lefever
Falk Hertwig
et al.
A2
Artikel in een tijdschrift
in
ONCOTARGET
2018
The study of degradation mechanisms of glyco-engineered plant produced anti-rabies monoclonal antibodies E559 and 62-71-3
Sindisiwe G Buthelezi
Heini W Dirr
Ereck Chakauya
Rachel Chikwamba
Lennart Martens
Tsepo L Tsekoa
Elien Vandermarliere
Stoyan H Stoychev
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS ONE
2018
2017
Methods to calculate spectrum similarity
Sule Yilmaz-Rumpf
Elien Vandermarliere
Lennart Martens
Hoofdstuk in een boek
in
Proteome bioinformatics
2017
Novel algorithms for two interesting challenges in proteomics : unsequenced organisms and cross-linked peptide identification
Sule Yilmaz-Rumpf
Lennart Martens
Elien Vandermarliere
Proefschrift
2017
2016
A pipeline for differential proteomics in unsequenced species
Sule Yilmaz-Rumpf
Bjorn Victor
Niels Hulstaert
Elien Vandermarliere
Harald Barsnes
Sven Degroeve
Surya Gupta
Adriaan Sticker
Sarah Gabriël
Pierre Dorny
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2016
An extra dimension in protein tagging by quantifying universal proteotypic peptides using targeted proteomics
Giel Vandemoortele
An Staes
Giulia Gonnelli
Noortje Samyn
Delphine De Sutter
Elien Vandermarliere
Evy Timmerman
Kris Gevaert
Lennart Martens
Sven Eyckerman
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2016
Resolution of protein structure by mass spectrometry
Elien Vandermarliere
Elisabeth Stes
Kris Gevaert
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MASS SPECTROMETRY REVIEWS
2016
The Lyssavirus glycoprotein : a key to cross-immunity
Sindisiwe G Buthelezi
Heini W Dirr
Ereck Chakauya
Rachel Chikwamba
Lennart Martens
Tsepo L Tsekoa
Stoyan H Stoychev
Elien Vandermarliere
A1
Artikel in een tijdschrift
in
VIROLOGY
2016
Xilmass: a new approach toward the identification of cross-linked peptides
Sule Yilmaz-Rumpf
Friedel Drepper
Niels Hulstaert
Maša Černič
Kris Gevaert
Anastassios Economou
Bettina Warscheid
Lennart Martens
Elien Vandermarliere
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ANALYTICAL CHEMISTRY
2016
2015
A novel STAT1 mutation in a patient with pneumocystis jiroveci and chronic mucocutaneous candidiasis
Delfien Bogaert
Melissa Dullaers
Jens Staal
Sarah Gerlo
Elien Vandermarliere
Veronique De Backer
Maria Bordon Cueto De Braem
KATHLEEN DE WAELE
Isabelle Meyts
Leen Moens
et al.
C3
Conferentie
2015
Limited proteolysis combined with stable isotope labeling reveals conformational changes in protein (pseudo)kinases upon binding small molecules
Michela Di Michele
Elisabeth Stes
Elien Vandermarliere
Rohit Arora
Juan Astorga-Wells
Jonathan Vandenbussche
Erika van Heerde
Roman Zubarev
Pascal Bonnet
Joannes TM Linders
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2015
PepShell : visualization of conformational proteomics data
Elien Vandermarliere
Davy Maddelein
Niels Hulstaert
Elisabeth Stes
Michela Di Michele
Kris Gevaert
Edgar Jacoby
Dirk Brehmer
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2015
Ryanodine receptors are targeted by anti-apoptotic Bcl-X-L involving its BH4 domain and Lys87 from its BH3 domain
Tim Vervliet
Irma Lemmens
Elien Vandermarliere
Elke Decrock
Hristina Ivanova
Giovanni Monaco
Vincenzo Sorrentino
Nael Nadif Kasri
Ludwig Missiaen
Lennart Martens
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2015
Scop3D : three-dimensional visualization of sequence conservation
Tessa Vermeire
Stijn Vermaere
Bert Schepens
Xavier Saelens
Steven Van Gucht
Lennart Martens
Elien Vandermarliere
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2015
Structural investigation of B-Raf paradox breaker and inducer inhibitors
Rohit Arora
Michela Di Michele
Elisabeth Stes
Elien Vandermarliere
Lennart Martens
Kris Gevaert
Erika Van Heerde
Joannes TM Linders
Dirk Brehmer
Edgar Jacoby
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
2015
2014
A novel Stat1 mutation leading to hyperphosphorylation in a patient with Pneumocystis jjiroveci and chronic mucocutaneous candidiasis
Melissa Dullaers
Jens Staal
Sarah Gerlo
Elien Vandermarliere
V Debacker
Maria Bordon Cueto De Braem
K De Waele
I Meyts
L Moens
X Bossuyt
et al.
C3
Conferentie
2014
Unraveling the specificities of the different human methionine sulfoxide reductases
Elien Vandermarliere
Bart Ghesquière
Veronique Jonckheere
Kris Gevaert
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2014
2013
Getting intimate with trypsin, the leading protease in proteomics
Elien Vandermarliere
Michael Mueller
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MASS SPECTROMETRY REVIEWS
2013
Predicting tryptic cleavage from proteomics data using decision tree ensembles
Thomas Fannes
Elien Vandermarliere
Leander Schietgat
Sven Degroeve
Lennart Martens
Jan Ramon
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2013
Protein structure as a means to triage proposed PTM sites
Elien Vandermarliere
Lennart Martens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROTEOMICS
2013
Vpr content of HIV-1 virions determines infection of resting peripheral blood CD4⁺ lymphocytes
Anouk Van Nuffel
Francis Impens
Ann Baeyens
Stijn Vanhee
Wojciech Witkowski
Elien Vandermarliere
Hanne Vanderstraeten
Evelien Naessens
Kathleen Van Landeghem
Sophie Vermaut
et al.
C3
Conferentie
2013