ab en gd T cellen hebben elk hun specifieke rol in het immuunsysteem. Ze ontstaan uit gemeenschappelijke voorlopercellen in de thymus, maar hoe en wanneer de keuze tussen ab en gd T cel ontwikkeling bij de mens wordt gemaakt blijft nog steeds onduidelijk. Het Taghon lab toonde recent aan dat thymocyten, wanneer ze beslissen om te ontwikkelen tot gd T cellen, sterke veranderingen ondergaan in hun chromatine status terwijl ontwikkelende ab T cellen dit niet lijken te doen. Dit suggereert dat de epigenetische regulatoren die deze T cel identiteit bepalen kunnen verschillen voor ab en gd T cellen, maar door de beperkingen van bulk analyses blijven de onderliggende moleculaire processen tot op heden onbekend. Daarom zal dit project gebruik maken van single cell sequencing technologieën om een gedetailleerd moleculair beeld te creëren van humane ab en gd T cel differentiatie. Hiervoor zullen we genexpressie, chromatine toegankelijkheid, cel oppervlaktemerkers en VDJ recombinatie in kaart te brengen tijdens dit ontwikkelingsproces. Dit zal ons helpen om de ab- of gd-specifieke veranderingen omtrent deze aspecten te karakteriseren en transcriptiefactoren te identificeren die een mogelijke rol spelen in deze ontwikkelingskeuze. Daarnaast zullen we via in vitro lineage tracing het exacte moment van ab vs. gd bifurcatie bepalen. De resultaten van dit project zullen dus, aan een ongekende resolutie, unieke inzichten opleveren in de mechanismen die ab vs. gd T cel ontwikkeling reguleren.