Project

iScan, een optimale oplossing voor hoge doorvoer (epi)genetica

Acroniem
iScan
Code
F2021/IOF-Equip/028
Looptijd
01-03-2021 → 31-12-2022
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Industrieel Onderzoeksfonds
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Machine learning and decision making
Trefwoorden
(Epi)genomica Pharmacogenetica Genotypering Veredeling FFPE staalanalyse
 
Projectomschrijving

Binnen dit project zal ingezet worden op 3 nieuwe onderzoekslijnen om een kost-efficiëntere workflow uit te werken voor (1) ) identificatie van leeftijd en gender-afhankelijke potentiële risico factoren voor COVID-19 infectie, (2) gepersonaliseerde nutrigenomics bij atleten, (3) bloed gebaseerde epigenetische klok testen uitvoeren naar identificatie van merkers voor healthy ageing. Het Illumina iSCAN-systeem is een high throughput array scanner die prijs-efficiënt een breed scala aan toepassingen ondersteunt. Het platform wordt voornamelijk gebruikt voor genoomwijde en op maat ontworpen single nucleotide polymorphism (SNP) genotypering. Dit platform zal binnen NXTGNT, expertise centrum voor NGS/(epi)genetica geïmplementeerd worden om hoge-resolutie single copy number variaties (CNV) te detecteren en om DNA methylatie en genexpressie-analyses uit te voeren. Doel van dit project is om hoge doorvoer epigenetica met de iSCAN aan te bieden aan academische en industriële partners via UGent’s NXTGNT faciliteit.