Serendipita is een genus van plantengroeibevorderende endofytische schimmels. In tegenstelling tot arbusculaire mycorrhizale schimmels lijkt Serendipita vooral groei te bevorderen door het manipuleren van het gastheermetabolisme, eerder dan via rechtstreekse nutriëntenopname. Hoe dit gebeurt is onduidelijk, deels omdat het groeibevorderende ‘signaal’ moeilijk te onderscheiden is van de ‘ruis’ van het kolonisatieproces. Kolonisatie induceert immers een immuunrespons en herprogrammering van transcriptoom, proteoom en metaboloom door o.a. microbe/damage-associated patterns, effectoren en celdood. Deze ‘achtergrondruis’ bemoeilijkt genetische screenings, -omics en andere high throughput-technieken. Eerder werk in onze groep resulteerde in een collectie van 51 Serendipita-isolaten, verdeeld in zeven taxonomisch ambigue genetische groepen. Plantperceptie van volatiele emissies van deze isolaten resulteert in gelijkaardige fenotypes als directe kolonisatie, waaronder groeibevordering, petioluselongatie, donkerder pigmentatie en laterale wortelelongatie. Deze volatielen laten dus mogelijk toe om groeibevordering door endofyten los te koppelen van het kolonisatieproces. In dit project gebruiken we genetische screening, transcriptomics en biotoetsen om groeibevordering door Serendipita-volatielen te bestuderen, phased genome sequencing om taxonomie en genoomstructuur van Serendipita te verduidelijken en metabolomics en genome mining om de volatielen van Serendipita te karakteriseren.