Bacterien produceren extracellulaire enzymen. Deze enzymen dienen in de eerste plaats om allerlei biopolymeren in de omgeving te degraderen tot eenvoudige bouwstenen die kunnen opgenomen worden en door de bacterien gemetaboliseerd worden. Deze enzymen zijn vaak hydrolasen en redoxeiwitten die gebruikt worden voor de afbraak van eiwitten, polysacchariden, lipiden etc. Het doel van dit onderzoek is om enzymen te identificeren en te karakteriseren waarbij we vooral zoeken naar enzymen met kenmerken die van belang zijn voor industriele toepassingen, zoals hoge temperatuur of pH stabiliteit. 

Sommige opportunistische bacterien gebruiken hun arsenaal aan enzymen helaas ook om hun gastheer te infecteren en het immuunsysteem te omzeilen. In een tweede deel van dit onderzoek zullen we ook  proteasen en andere eiwitdegraderende enzymen bestuderen  die betrokken zijn bij de pathogenese van bacterien die geassocieerd worden met ziekenhuisinfecties zoals Burkholderia cenocepacia and Stenotrophomonas maltophilia.