Project

Long Read Sequencing voor de detectie van cryptische structurele variatie bij patiënten met een verstandelijke beperking en aangeboren afwijkingen

Code
3179Q03419
Looptijd
01-10-2019 → 30-09-2023
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Promotor-woordvoerder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified
Trefwoorden
verstandelijke beperking
 
Projectomschrijving

Opeenvolgende technologische innovaties hebben herhaaldelijk een revolutie teweeg gebracht in de genetische diagnostiek. Sinds in 1959 trisomie 21 als oorzaak van Down syndroom werd geduid door de introductie van conventioneel chromosomenonderzoek, werd de afgelopen 60 jaar de moleculaire oorzaak voor >5.000 genetische aandoeningen opgehelderd (OMIM, "Online Mendelian Inheritance in Man"). Met de huidige state-of-the-art technologieen, gebaseerd op 2e generatie sequenering kunnen we grotere chromosomale deieties/duplicaties (>50 kilobasen) met behulp van genoomwijde kopij analyse detecteren en basepaarsubstituties en kleine deieties/duplicaties (<50 baseparen) met behulp van whole exome sequenering. Desondanks deze technologische innovaties, kan bij ongeveer 40% van de patienten met een verstandelijke beperking aangeboren afwijkingen nog steeds geen moleculaire oorzaak gevonden worden. We verwachten dat kleine en middelgrote structurele

herschikkingen (50 bp-50 kb) een groot deel van deze onopgeloste gevallen verklaren. We gaan "single-molecule Long Read Sequencing" introduceren om de diagnostische opbrengst in deze patientengroep te verbeteren en daarmee ook de patientenzorg te optimaliseren met

betrekking tot preventieve, therapeutische en reproductieve opties.