ODEEP-EU zal een cruciale doorbraak teweegbrengen in het ecosysteem van open data-uitwisseling binnen de proteoomanalyse, door ervoor te zorgen dat openbare gegevens in massaspectrometrie-gebaseerde proteoomanalyse maximaal hergebruikt kunnen worden, zowel binnen het veld zelf, als binnen de levenswetenschappen in het algemeen, en dit tot ver in de toekomst. Dit overkoepelende doel zal worden bereikt door middel van vijf doelstellingen, waarvan er twee gericht zijn op essentiële inspanningen om heranalyse en hergebruik in het veld zelf mogelijk te maken, en waarvan er drie gericht zijn op het opstarten van breed hergebruik in de bredere levenswetenschappen. Het hergebruik in het veld zelf vereist momenteel twee cruciale zaken, die in de eerste twee doelen worden aangepakt: (i) het verstrekken van uitgebreide en betrouwbare metadata voor openbaar beschikbare datasets; en (ii) de beschikbaarheid van een verscheidenheid aan zeer goed geannoteerde en zorgvuldig gekarakteriseerde referentiedatasets die kunnen dienen als belangrijke benchmarks, tutorials en sjablonen. Aan de andere kant zal breed extern hergebruik binnen de bredere levenswetenschappen opgestart worden door drie gecoördineerde en direct complementaire inspanningen, die zich vertalen in de volgende drie doelen: (iii) creatie van geavanceerde analyse software voor de geautomatiseerde informatiestroom van proteoomanalytische gegevens naar de UniProt Knowledgebase voor eiwitsequentie- en contextinformatie, en naar de Protein Data Bank voor structurele eiwit-informatie, waar alle geïnteresseerde onderzoekers binnen de levenswetenschappen deze informatie makkelijk kunnen vinden en hergebruiken in de breedst mogelijke context; (iv) creatie van een baanbrekende, ontdekkingsgedreven, voorbeeld scenario van hergebruik van proteomics-gegevens, gebaseerd op het verduidelijken van de biologische betekenis van, in publieke gegevens gedetecteerde proteoom-brede eiwitmodificaties; en (v) doorgedreven inspanningen rond educatie en disseminatie van de doelstellingen en resultaten van dit project, steeds geworteld in open wetenschap, en dit via standaard academische kanalen, via interacties met de industrie in de levenswetenschappen, en naar het brede publiek. Op deze manier kan dit ODEEP-EU project twee decennia van inspanningen in de oprichting van open wetenschapsinfrastructuur in de proteoomanalyse benutten als een unieke basis om het veld nog duidelijker te positioneren als een schier onuitputtelijke schatkamer van belangrijke nieuwe kennis en inzichten voor de levenswetenschappen in het algemeen.