-
Natural sciences
- Plant biochemistry
- Plant genetics
Populier (Populus spp) is een belangrijk biomassagewas voor de productie van hout, pulp en papier. Daarnaast wordt populier ook veel gebruikt als model voor moleculair-genetisch onderzoek in bomen, waardoor de functie van steeds meer genen ontrafeld wordt. Er blijven echter grote hiaten in het ophelderen van de biosynthesewegen voor gespecialiseerde metabolieten. Dit project heeft tot doel genomische, transcriptomische en metabolische gegevens te gebruiken om biosynthesewegen voor gespecialiseerde metabolieten in populier te ontdekken, met de nadruk op biosynthetische genenclusters (BGC's). Hoewel het merendeel van de biosynthesegenen verspreid ligt op het genoom, is er steeds meer bewijs voor de aanwezigheid en het belang van geclusterde biosynthesegenen (BGC's) die instaan voor het gespecialiseerde metabolisme in planten. Door middel van een op metabolieten gebaseerde genoomwijde associatiestudie (GWAS) wensen we genomische loci te identificeren die BGC's bevatten die geassocieerd zijn met de abundantie van bepaalde gespecialiseerde metabolieten in het populierengenoom. Dit onderzoek belooft niet alleen de identiteiten van nieuwe populiermetabolieten en hun biosynthesewegen op te helderen, het zal ook de weg vrijmaken voor potentiële toepassingen in de biotechnologie en industriële processen. Daarnaast zal een beter begrip van de rol die BGC's spelen in de adaptatie en evolutie van populier bijdragen aan de veredeling van populier als houtproducerend gewas.