Project

Sleutelrol en diversiteit van het EcR/USP nucleair receptorcomplex bij Arthropoda.

Code
3G009610
Looptijd
01-01-2010 → 31-12-2015
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Promotor
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Plant biology
  • Agricultural and food sciences
    • Agricultural plant production
    • Horticultural production
Trefwoorden
EcR/USP Arthropoda
 
Projectomschrijving

De nucleaire receptoren (NR's), een belangrijk eiwit superfamilie van transcriptiefactoren gevonden in alle dieren, de expressie van genen in een groot scala aan biologische processen. Hun betrokkenheid bij de rui en metamorfose, embryonale ontwikkeling, celdifferentiatie en reproductie van geleedpotigen is goed gedocumenteerd. Vooral de twee NR's die de functionele ecdysteroid receptor vormen en die aan de basis van de ecdysteroid signaalcascade regulerende rui en metamorfose, EcR en USP, zijn intensief onderzocht. Door de evolutie zijn genduplicatie en gen schadegevallen een grote diversiteit van deze NRs tussen verschillende groepen in het dierenrijk gecreëerd. Echter, in 2008, op het moment dat dit promotieonderzoek begon, is de informatie die beschikbaar is op geleedpotigen NRs was, was voornamelijk beperkt tot insecten holometabolic. Complete sets van NRs voor andere groepen, waaronder Crustacea, Chelicerata of meer basale insecten niet beschikbaar waren. In de afgelopen jaren, is het aantal van het genoom sequencing projecten die voor overig worden uitgevoerd snel toe. Dit gaf ons de gelegenheid om de NR's in een aantal andere geleedpotigen de sets van NRs te onderzoeken en te vergelijken tussen sommige van deze groepen. We kozen voor drie soorten, de hemimetabolic erwt Acyrthosiphon pisum, de holometabolic-buff tailed hommel Bombus terrestris en de chelicerate twee-spotted spint spint als vertegenwoordigers van hun respectieve clades. De belangrijkste onderzoeksvragen die in het proefschrift waren gericht waren: (1) Gebruik holometabolic, hemimetabolic en non-insect geleedpotigen vertonen belangrijke verschillen in hun sets van nucleaire receptoren ?, (2) Wat zijn de gevolgen in de richting van de ecdysteroid signalerende cascade en kan verschillen daar te vinden ?, en (3) kan worden gebruikt om RNAi functionele informatie aan de fundamentele gegevens die deze genoomannotatie analyses bezorgd?