Project

Structuur en dynamica van anaplastic lymphoma kinase in complex met cytokinen via integratieve structurele biologie

Code
1195426N
Looptijd
01-11-2025 → 31-10-2029
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • (Bio)molecular modelling and design
  • Medical and health sciences
    • Molecular biophysics
    • Structural biology
    • Cell signalling
Trefwoorden
Structurele biologie Cytokine receptoren Moleculair modelleren
 
Projectomschrijving
Anaplastisch lymfoom kinase (ALK) is een receptor tyrosine kinase dat betrokken is bij metabolisme en neurale ontwikkeling. ALK is een proto-oncogen wiens afwijkende activatie betrokken in meerdere kankers, waardoor de receptor een gegeerd therapeutisch doelwit is. Voorgaand onderzoek heeft geprobeerd om het ontbrekend mechanisme voor de activatie van ALK-familie receptoren door de cytokines ALKAL1/2 te bepalen. De huidige modellen zijn echter beperkt tot de extracellulaire, cytokine-bindende domeinen van ALK, en het gerelateerde LTK. Hierdoor is niet goed begrepen hoe ALK-ligand complexen het vermogen krijgen om te signaliseren en wat de rol van de andere eiwitdomeinen is hierin. Om dit gebrek aan inzicht in ons structureel begrip van cytokine-gemedieerde ALK activatie aan te kaarten willen wij structuurbepaling via elektronenmicroscopie integreren met de computationele modellering van eiwitten. Hierbij maken we gebruik van innovatieve moleculaire tools die structuurbepaling toelaten via cryo-EM op receptor-ligand complexen geïsoleerd uit membranen, en cryo-EM en cryo-ET op vesikels die ALK bevatten. Door deze volledige structuren van ALK te integereren met moleculaire simulaties zullen we een beschrijving verkrijgen van de structurele gebeurtenissen die leiden tot activatie van ALK. Hiermee wensen we een duidelijk mechanistische omkadering te bieden voor de activatie van ALK en daarbij inzichten te verkrijgen voor de biologie van ALK en ALK als therapeutisch doelwit.