-
Natural sciences
- Single-cell data analysis
- Cell signalling
-
Medical and health sciences
- Cancer biology
Verschillende cellulaire toestanden (TS,“tumor states”) komen voor in tumoren, waarbij sommige kankercellen actief delen, anderen differentiëren, naburig weefsel invaderen, uitzaaiingen veroorzaken of verkeren in een toestand die resistent is tegen therapie. De identificatie van de intrinsieke en extrinsieke mechanismen die TS diversiteit moduleren is essentieel voor de ontwikkeling van nieuwe therapeutische strategieën. In dit project bestuderen we het belang van de cellulaire communicatie tussen tumor en stroma, op de gen-regulatorische netwerken (GRN) die TS reguleren in huidkanker. We maken gebruik van single-cell lineage tracing, single-cell spatiale multi-omics, microfluidica, en bio-informatica, om het spatiale voorkomen van de verschillende TS en hun naburige stromale cellen in kaart te brengen; en om de impact te bepalen van deze cellulaire en moleculaire (e.g., ligand/receptor) interacties op de GRNs die TS identiteit controleren. We zullen dynamische modellen gebruiken om te onderzoeken hoe deze interacties veranderen gedurende tumorprogessie,metastase, en therapie-respons. Verder zullen we functioneel onderzoeken hoe het assembleren of verbreken van cel-interacties tussen stroma en tumor of het verbreken van hun onderlinge moleculaire communicatie, de GRNs van verschillende TS beïnvloeden. Tenslotte zullen we bestuderen hoe farmacologische interventies die inwerken op de stroma-tumor communicatie, de tumorgroei, metastase, en therapie-resistentie kunnen inperken.