Project

Onbewandelde paden in eiwitevolutie: inserties en deleties als aandrijvers van functionele innovatie

Code
1226424N
Looptijd
01-10-2023 → 30-09-2026
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Promotor
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Engineering and technology
    • Biocatalysis and enzyme technology
Trefwoorden
indel mutaties enzym engineering eiwit evolutie
 
Projectomschrijving

De ontwikkeling van enzymen en antilichamen die aan specifieke economische noden voldoen is een sleuteltechnologie voor onze sterke Vlaamse biotechsector. Jammer genoeg maken de hedendaagse strategieën voor gestuurde eiwitevolutie geen gebruik van het volledige gamma aan mutaties die in de natuur voor functionele innovatie kunnen zorgen. De focus ligt traditioneel op substituties van aminozuren. Inserties en deleties (indels) worden daarentegen zelden onderzocht, terwijl ze een bijzonder vaak voorkomende vorm van genetische variatie zijn. Alhoewel het gebruik van indels nog in zijn kinderschoenen staat, weten we wel dat ze de eigenschappen van eiwitten zeer sterk kunnen beïnvloeden, zowel in goede als in slechte zin. In dit project zal ik krachtige, op indels gebaseerde strategieën ontwikkelen voor het engineeren van eiwitten, en zullen ook de effecten van deze bijzondere mutaties bestudeerd worden op het moleculaire niveau. Deze inspanningen zullen zich niet beperken tot indels die het leesraam niet verstoren. Ook het intrigerende potentieel van frameshift mutaties, die de daaropvolgende eiwitsequentie grondig veranderen, zal onderzocht worden. Ik verwacht dat de verworven inzichten niet enkel onze toolbox voor eiwit engineering zullen uitbreiden, maar ook onze kijk op de evolutie van eiwitten.