Project

Digitale pathologie als proxy voor het moleculair profileren van prostaattumoren

Code
BOF/IOP/2022/045
Looptijd
01-10-2022 → 30-09-2026
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Promotor-woordvoerder
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Machine learning and decision making
    • Image processing
    • Development of bioinformatics software, tools and databases
  • Medical and health sciences
    • Anatomical pathology
    • Computational biomodelling and machine learning
Trefwoorden
anatomische pathologie Data-integratie Bio-informatica kankerbiologie data visualisatie en beeldanalyse
 
Projectomschrijving

 

Histologische beelden van tumoren worden routinematig verzameld in klinische labo’s en reflecteren het fysiologische fenotype van de onderliggende cellen en hun genomische aberraties. Deep learning biedt de mogelijkheid om uit deze beelden verborgen morfologische eigenschappen te extraheren die associëren met moleculaire kenmerken. Histologische beelden bevatten dus impliciet waardevolle, maar tot dusver onbenutte informatie over de spatiale organisatie van moleculaire kenmerken. We willen hier deep learning modellen ontwikkelen die beeldinformatie kunnen gebruiken als kost-efficiënte proxy voor het moleculair profileren van tumorstalen.

Als gevalstudie zullen we deep learning modellen trainen die a.h.v. beeldinformatie moleculaire eigenschappen geassocieerd met metastatische prostaatkanker voorspellen. Het combineren van deze modellen met een in-house cohorte die speciaal hiervoor werd gedesigned, zal leiden tot de identificatie van modellen met prognostische waarde.