-
Medical and health sciences
- Laboratory medicine
- Medical systems biology
- Laboratory medicine
- Medical systems biology
- Molecular and cell biology
- Laboratory medicine
- Medical systems biology
- Molecular and cell biology
De MYC-familie van transcriptiefactoren behoort tot de meest frequent geactiveerde oncogenen bij kanker. Tientallen jaren van intensief onderzoek hebben geleid tot een vrij uitgebreid beeld van de overvloed aan proteïne-coderende genen die betrokken zijn in het MYC-transcriptionele netwerk. Onlangs hebben we aangetoond dat MYC-genen de expressie van microRNA's (miRNA's) kunnen transactiveren, een specifieke klasse van kleine niet-coderende RNA's die betrokken zijn bij posttranscriptionele regulatie van genexpressie. Daarnaast zijn miRNA's geïdentificeerd die functioneren bovenstrooms van MYC-genen en de expressie ervan direct reguleren. Het doel van dit project is om de rol van een opkomende klasse van niet-coderende RNA-moleculen, de lange niet-coderende RNA's of lncRNA's, in het MYC-netwerk te evalueren. LncRNA's zijn de meest voorkomende klasse van niet-coderende RNA-moleculen en zijn pas onlangs in detail beschreven. Om MYC-gereguleerde lncRNA's te identificeren, zal ik lncRNA-expressie in verschillende MYC-modelsystemen profileren en MYC-binding aan kandidaat-lncRNA-promotorregio's evalueren. In vitro en in vivo verstoring van de geïdentificeerde lncRNA's zal worden uitgevoerd om hun functies en vermoedelijke doelen te beoordelen. LncRNA's met het potentieel om MYC te reguleren zullen worden geïdentificeerd door middel van een integratieve analyse van passende lncRNA- en eiwitcoderende genexpressiegegevens. Kandidaat MYC-regulerende lncRNA's zullen in vitro worden gestoord om hun effect op de MYC-activiteit te beoordelen. De bevindingen kunnen aanleiding geven tot nieuwe en aantrekkelijke doelen voor antikankertherapie.