-
Natural sciences
- Biogeography and phylogeography
- Biology of adaptation
- Molecular evolution
- Phylogeny and comparative analysis
- Speciation
- Microbiology not elsewhere classified
Diatomeeën zijn een groep zeer diverse, wereldwijd dominante microalgen die aanzienlijk bijdragen aan de globale primaire productie en biogeochemische kringlopen. Het begrijpen van soortvorming in diatomeeën, alsook hoe diatomeeën zich aanpassen aan veranderingen in hun omgeving, is daarom een belangrijke onderzoeksinteresse. Hoewel de fenotypische uitkomsten van adaptatie reeds aanzienlijk onderzocht werden, begrijpen we weinig over de genomische achtergrond van speciatie en adaptatie in diatomeeën. Om deze kenniskloof te dichten zal ik me richten op twee zeer soortenrijke, evolutionaire radiaties van niet-modeldiatomeeën die worden gekenmerkt door de herhaaldelijke kolonisatie van verschillende klimaatzones gedurende hun evolutionaire geschiedenis, maar die zich afspeelden in verschillende ecologische omstandigheden - namelijk aquatische en terrestrische habitats. Vergelijkende analyses van genomen en transcriptomen verkregen van taxa die in polaire, gematigde of tropische gebieden voorkomen - en die evolutionair van elkaar gedivergeerd zijn op een reeks verschillende tijdschalen - zullen worden aangevuld met experimentele evolutie- en laboratoriumkruisingsexperimenten. Als zodanig zal ik de bijdragen van zowel genoom- als genexpressie-evolutie in speciatie en adaptatie over macro- en micro-evolutionaire tijdschalen onderzoeken, en zo verschillende stadia van het speciatie- en adaptatieproces vastleggen. Door de twee evolutionaire radiaties te contrasteren binnen een duidelijke fylogenetische vraagstelling, zal ik (i) algemene inzichten formuleren in de genomische basis van speciatie en adaptatie in diatomeeën, (ii) de mate van divergentie en herhaalde evolutie in adaptieve oplossingen onthullen, en (iii) uitzoeken of, en hoe, adaptatie wordt beperkt door de evolutionaire geschiedenis van een taxon, inclusief verschillen in ecologie en populatiegrootte. Al met al zal de integratie van macro- en micro-evolutionaire benaderingen op de schaal van genoom- en genexpressie-divergentie een diepgaand begrip van speciatie en adaptatie in een belangrijke microbiële clade genereren.