-
Natural sciences
- Phytopathology
- Plant cell and molecular biology
- Plant immunology
- Interactomics
Agrobacterium is een fascinerende bacteriële plantpathogeen die bekend staat om zijn vermogen om genetisch materiaal in het plantengenoom over te brengen. Dit heeft geleid tot de creatie van planten met wenselijke agronomische eigenschappen. Plant-pathogeen interacties worden bepaald door complexe interactie-netwerken tussen bacteriële effectoren en planteneiwitten. Daar onderzoek naar bacteriële DNA-overdracht en integratie het Agrobacterium-onderzoek domineert, is kennis over hoe effectoren plantafweerreacties onderdrukken onvolledig. Voor veel plantensoorten, en specifiek monocotylen, blijft genetische transformatie uitdagend. Om deze kenniskloof aan te pakken, zullen we de nieuwste proteomica-technieken gebruiken om nieuwe effector-planteneiwit interacties te identificeren binnen de gastheercel. Tegelijkertijd zullen we twee benaderingen toepassen om potentiële nieuwe effectoren te identificeren. We zullen eiwitten karakteriseren die worden getransporteerd door het secretiesysteem binnen Agrobacterium en daarnaast bacteriële eiwitten in planta identificeren. Ten slotte, zullen we planteneiwitten functioneel karakteriseren in maïs en Arabidopsis en de rol van zowel nieuwe effectoren als planteneiwitten bij infectie bestuderen. Onze uitgebreide benadering zal leiden tot een dieper inzicht in deze rijkoverschrijdende interactie en finaal tot verbeteringen van biotechnologische toepassingen.