Via een modelsysteem van de menselijke darm zullen we onderzoeken hoe microbiële gemeenschappen - gekenmerkt door verschillende structuren en functies - reageren onder veranderende omgevingsfactoren en biologische invasie. Uit deze informatie zullen we voorspellende ecologische modellen ontwikkelen. Verder zullen de verkregen resultaten gevalideerd worden door het werken met menselijke microbiota-geassocieerde muismodellen die aan relevante fysiologische stressoren worden onderworpen.