Er is aangetoond dat multiple pluripotente stamcellen in de mens voorkomen, vergelijkbaar met de muis
model, zal het belangrijk zijn om die stamcelsoorten in detail te karakteriseren en te analyseren
verschillen. We veronderstellen dat de verschillende kweek- en afleidingscondities een a zullen hebben
substantiële impact op de genomische stabiliteit en differentiatiepotentieel van de resulterende stamcel
types.
Ten eerste zullen we een diepgaande transcriptomische en (epi) genomische karakterisering uitvoeren en
vergelijking van onze in eigen huis gevestigde primed, naïef en IWP2-geïnduceerde hESC-lijnen. Ten tweede, door
het uitvoeren van single cell genomics, genomische heterogeniteit binnen de verschillende hESC-culturen zal zijn
onthuld voor de eerste keer (WP1).
Vervolgens willen we de rol van replicatieve stress als drijvende kracht voor genomische instabiliteit onderzoeken
in hESCs. Hiervoor zullen we experimenteel onze in-house afgeleide primed, naïeve en IWP2-
geïnduceerde hESCs en monitormarkers voor replicatieve stress en de gevolgen daarvan voor de
transcriptoom en epigenoom op verschillende tijdstippen (WP2).
Ten slotte willen we het spontane, gerichte en doelgerichte (neuronale en primordiale) vergelijken
kiemcel voorlopercellen) differentiatiepotentieel van de verschillende typen hESCs (WP3), welke
zal belangrijke informatie geven voor toekomstige mogelijke regeneratieve toepassingen.