-
Natural sciences
- Computational transcriptomics and epigenomics
- Structural bioinformatics and computational proteomics
- Plant cell and molecular biology
- Plant genetics
- Plant morphology, anatomy and physiology
De voorbije decennia hebben aangetoond dat ethyleen een cruciale speler is in de controle van de groei en ontwikkeling van planten. Recent is echter gebleken dat diens directe biosynthetische precursor, 1-aminocyclopropaan-1-carboxylaat (ACC), ook onafhankelijk van ethyleen kan functioneren. In beide scenarios is het dus van vitaal belang dat de biologische beschikbaarheid van ACC, door transport en conjugatie, strikt wordt gecontroleerd. De moleculaire mechanismen die aan de basis liggen van deze processen zijn echter tot dusver onbekend, ondanks hun belangrijke fysiologische functie. In dit project trachten we, via een combinatie van computationele en empirische benaderingen, een gedetailleerd beeld te krijgen van ACC-gerelateerde processen. Hierbij is er in het bijzonder aandacht voor de evolutionaire geschiedenis van de pathway, maar zal er tevens gebruik worden gemaakt van de goudmijn aan data gegenereerd door diverse ‘-omics’ technologieën. Via deze synergistische benadering zullen belangrijke spelers in het ACC transport en conjugatie worden geïdentificeerd in silico, waarna ze functioneel zullen gekarakteriseerd worden. De evidentie voor de betrokkenheid van nieuwe, bona fide transporters en conjugators zal een licht werpen op de controle van ACC beschikbaarheid. Dit project zal derhalve niet enkel leiden tot vooruitgang in het domein van ACC homeostase, maar zal ook toelaten om nieuwe inzichten in ethyleenbiologie te verkrijgen.