Project

PErsooNlijk Genoom beVRaging IN klinische praktijken (PENGVIN)

Code
1S27825N
Looptijd
01-11-2024 → 31-10-2028
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Medical and health sciences
    • Development of bioinformatics software, tools and databases
  • Engineering and technology
    • Bio-informatics
    • Other computer engineering, information technology and mathematical engineering not elsewhere classified
Trefwoorden
Gefedereerd bevragen Gegevensprivacy Solid
 
Projectomschrijving

Medische zorg wordt steeds persoonlijker door het gebruik van genetische informatie van patiënten. Op dit moment zijn klinische gegevens, waaronder genomische data, vaak verspreid, willekeurig georganiseerd en opgeslagen in datasilo's. Samen met strenge privacyregels, hoge opslagkosten en beperkte infrastructuur voor gegevensdeling, beperkt de schaalbaarheid van gepersonaliseerde klinische strategieën. Mijn voorgestelde doctoraat streeft ernaar de deelbaarheid van de opslag van genomische gegevens te verbeteren, terwijl de gegevensprivacy behouden blijft, om de kosten van het gebruik van patiëntgenoomgegevens in de klinische praktijk te verlagen. Dit door de implementatie van een op burgers gericht opslagkader dat inzichten uit verschillende onderzoeksgebieden van het semantische web integreert tot een praktische oplossing voor klinisch gebruik. Concreet zal ik (a) patiëntgenomische gegevens opslaan via Solid-pods, (b) persoonlijke genoomsequentiegegevens voorstellen met behulp van RDF als gelinkte gegevens, (c) beleid toepassen op opgeslagen gegevens, en (d) innovatieve link-traversiequeries ontwikkelen voor gegevensherstel. Met dit onderzoek beoog ik een allesomvattend kader te bieden, aangevuld met een gebruiksvriendelijke webtoepassing, om praktische acceptatie in klinische settings te vergemakkelijken. Uiteindelijk streeft dit doctoraat naar een proof-of-concept voor de opslag van klinische genomische gegevens, en de weg vrij te maken voor gepersonaliseerde geneeskunde.