

-
Natural sciences
- Microbiomes
Momenteel vertrouwen we op antibiotica om potentieel levensbedreigende gastro-intestinale (GI) bacteriële infecties te bestrijden. De gevoeligheid voor infectie en de ernst van de symptomen kunnen echter aanzienlijk verschillen tussen individuen die aan dezelfde ziekteverwekker worden blootgesteld.1-3 Als we de factoren zouden kunnen ontrafelen die verantwoordelijk zijn voor verschillen in infectiegevoeligheid, zouden we strategieën kunnen formuleren om de incidentie van symptomatische infecties te verminderen, waardoor uiteindelijk levens worden gered en de behoefte aan antibiotica afneemt. Traditioneel hebben onderzoekers deze puzzel vanuit twee invalshoeken benaderd: een mensgerichte benadering, waarbij de fijne kneepjes van het immuunsysteem van de gastheer worden onderzocht, of een pathogeengerichte benadering, waarbij variaties in bacteriestammen worden onderzocht. Met CoRe defense pleit ik voor een paradigmaverschuiving door te kiezen voor een microbiota-gecentreerd perspectief. Deze benadering is gebaseerd op het concept van kolonisatieresistentie, het mechanisme waarbij de darmmicrobiota zichzelf beschermt tegen het binnendringen van nieuwe micro-organismen. Ondanks hun enorme potentieel om bacteriële infecties te voorkomen en te behandelen, zijn microbiële alternatieven voor antibiotica nog steeds dun gezaaid omdat we momenteel niet beschikken over adequate methoden om potentiële kandidaten te selecteren.
Mijn doel is om een methode te ontwikkelen voor de selectie van gepersonaliseerde bacteriële consortia die Campylobacteriosis kunnen voorkomen. Ik zal dit doen door de ecologische niche en concurrenten te onderzoeken via metabole modellering, te screenen op groeireducerende bacteriestammen of consortia met behulp van een nieuw ontwikkeld in vitro co-cultuurplatform, en de voorspellingen van kolonisatieresistentie van een eenvoudig model te testen op basis van deze in silico en in vitro resultaten in humaan-microbioom geassocieerde muizen. Door de beschermende functie van de microbiota te onderzoeken, zal ik baanbrekende bevindingen genereren die ons begrip van factoren die bepalend zijn voor de gevoeligheid voor bacteriële infecties zullen veranderen. Het zal een tijdperk inluiden waarin we bacteriën niet alleen als het probleem zien, maar ook als een deel van de oplossing.