(Bacterio)faaglysines worden ontwikkeld als enzym-gebaseerde antibiotica met een uitstekend potentieel om antibiotica-resistentie te bestrijden. Het lead lysine wordt momenteel geëvalueerd in een klinische fase III test. Wat lysines het meest onderscheidt van alle andere klassen van antibiotica is hun modulariteit en de mogelijkheden die hieruit ontspruiten om hun antibacteriële eigenschappen op maat aan te passen. Lysines vertegenwoordigen daarom een nieuwe klasse van antibiotica. Toenemende inspanningen worden gedaan om deze modulariteit te exploiteren, maar deze blijven vaak nog empirisch en een brute-kracht aanpak is nodig om lead lysines te identificeren. In mijn postdoctoraal voorstel beoog ik de slechts oppervlakkige kennis van modulaire lysines te verdiepen vanuit evolutionair oogpunt. Specifiek wil ik de evolutionaire drift en shift processen die lysine-evolutie aansturen om de faagfitheid, lysekinetica en specificiteit te optimaliseren, begrijpen. Daarvoor zal ik complementaire computationele en experimentele technieken toepassen, gebruik makende van recente innovaties in het proteïnedomein (AlphaFold, reconstructie van voorloper proteïnen, VersaTile assemblage) en synthetische biologie (aanmaak van synthetische lytische fagen) om fundamentele vragen die voordien niet beschouwd konden worden, te beantwoorden. Ik verwacht dat deze fundamentele inzichten een hefboomwerking zullen hebben op de inspanningen om lysines op maat te ontwerpen als krachtige antibiotica.