-
Natural sciences
- Analysis of next-generation sequence data
- Microbiomes
- Soil biology
-
Agricultural and food sciences
- Agrochemistry and fertilisers
- Crop science
In vorig onderzoek toonde ik aan dat chitine beschouwd kan worden als een alternatief voor minerale meststoffen in teeltsubstraten. Chitine promoot de groei van sla en aardbei en verandert de microbiële gemeenschap in witveen en de rhizosfeer, de grond rond de plantenwortel. Deze verandering in microbiële gemeenschap en de activatie van sleutel-microorganismen, zijn vermoedelijk essentieel voor de positieve werking van chitine op de plant. Echter, wie de “sleutel” is en hoe ze de chitine-gerelateerde plantengroei bewerkstelligen is nog een vraagteken. We gaan uit van drie mechanismen: (1) de vrijstelling van N door microbiële chitine degradatie; (2) deactelyatie van chitine naar chitosan, een gekende plantgroeipromotor; en (3) de activatie van andere microbiële mechanismen die plantengroei stimuleren. Dit project zal het werkingsmechanisme van chitine op plantengroei door activatie van de microbiële gemeenschap ontrafelen. Hiervoor worden eerst de chitine degradeerders geïdentificeerd door een combinatie van stabiele isotopen en metagenomics. Ten tweede wordt targeted metabolomics en metatranscriptomics gebruikt om de chitine degradatie te kwantificeren. Ten slotte zal gescreend worden naar plantengroei promotie en chitine-degradatie eigenschappen van microorganismen via bioassays, waaronder een snelle screening die ik op punt zal stellen om de sleutelorganismen/enzymen op te sporen in teeltsubstraten, om zo de doeltreffendheid van chitine te voorspellen.