Project

Grootschalige genoombewerking in het groen zeewier Ulva mutabilis

Code
BOF/STA/202209/016
Looptijd
01-01-2023 → 31-12-2026
Financiering
Gewestelijke en gemeenschapsmiddelen: Bijzonder Onderzoeksfonds
Promotor
Onderzoeksdisciplines
  • Engineering and technology
    • Algae biotechnology
Trefwoorden
CRISPR Zeewier moleculair kloneren algen biotechnologie
 
Projectomschrijving

Zeewieren zijn belangrijke primaire producenten en hebben kenmerken die interessant zijn vanuit industrieel oogpunt. Desondanks zijn er amper functionele gen karakterisatie studies in deze organismen. Ulva is momenteel het enige zeewier waar transgenen efficiënt tot expressie gebracht kunnen worden; genen muteren via CRISPR is mogelijk, maar inefficiënt. Om grootschalige mutantenstudies mogelijk te maken moeten we CRISPR-efficiëntie drastisch verhogen. In dit project zullen we verschillende CRISPR-toepassingen (KO, base editing en homologie-gericht DNA herstel) optimaliseren met behulp van ons modulair kloneringssyteem. Daarnaast evalueren we of omgeving (hitte, stikstof deprivatie) CRISPR-efficiëntie kan verhogen. Door iteratief de beste factoren te optimaliseren willen we de CRISPR-efficiëntie verhogen van momenteel <1% tot >50% aan het einde van dit project. Hierdoor worden grootschalige onderzoeken naar de functie van Ulva genen mogelijk voor basis en toegepast onderzoek.