Project

Ontwerp en optimalisatie van synthetische DNAzymen: ontwikkeling van een geïntegreerde structuuranalyse aanpak

Code
3G042213
Looptijd
01-01-2013 → 31-12-2018
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Humanities
    • Other philosophy, ethics and religious studies not elsewhere classified
    • Other humanities and the arts
Trefwoorden
DNA herstel
 
Projectomschrijving

Catalysis speelt een essentiële rol in de moderne chemisch onderzoek en in de chemie van het leven. Het maakt het mogelijk om complexe moleculaire structuren en maakt het mogelijk en versnelt transformaties. Een miljard jaar evolutie kon de ontwikkeling van op eiwit gebaseerde enzymen als natuurlijke katalysatoren met een hoge efficiëntie en selectiviteit. Het creëren van kunstmatige katalytische systemen geïnspireerd door de natuur is nu uitgegroeid tot een tijdige menselijke inspanning. DNA is een grotendeels onbenut potentieel op dit gebied. Door het uitrusten van korte DNA-strengen met eiwitachtige functionele groepen door middel van chemische synthese, kunnen kunstmatige DNA gebaseerde enzymen worden gemaakt met katalytische plaatsen aangebracht op de vrij rigide, programmeerbare en voorspelbare DNA duplexstructuur. In dit project kernspinresonantie spectroscopie, aangevuld met röntgendiffractie, wordt gebruikt om te onderzoeken, structuur, conformatie en chemische integriteit van deze DNAzymen. Twee enzym klassen worden beschouwd, geïnspireerd op serineproteasen en esterasen. Daarbij zullen nieuwe spectroscopische methoden, deels met een beroep op de invoering van bepaalde stabiele isotopen worden ontwikkeld. Wanneer voltooid, zal een diepgaande het licht van de DNAzymes in onderzoek beschikbaar zijn en een geïntegreerde structuur analyse aanpak zal zijn geschetst, die beide kunnen worden gebruikt om waardevolle aanwijzingen te geven in het ontwerp en de ontwikkeling van toekomstige generaties van deze en andere chemisch gemodificeerde DNAzymes.