Project

Wat loopt er fout met ILCs? Onderzoek naar het mechanisme van ILC depletie en hun functies tijdens HIV infectie

Code
11I7423N
Looptijd
01-11-2022 → 31-10-2024
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Mandaathouder
Onderzoeksdisciplines
  • Medical and health sciences
    • Computational transcriptomics and epigenomics
    • Single-cell data analysis
    • Applied immunology
    • Innate immunity
    • Virology
Trefwoorden
Aangeboren lymfoïde cellen Humaan Immunodeficiëntie Virus Functionaliteit
 
Projectomschrijving

HIV is een virus dat immuuncellen infecteert en reservoirs vormt in secundaire lymfoïde organen (SLOs). Omdat geïnfecteerde cellen worden vernietigd leidt infectie tot immuundeficiëntie die dodelijk is indien behandeling met antiretrovirale therapie (ART) uitblijft. HIV infectie brengt ook schade toe aan de darmbarrière, hetgeen leidt tot chronische activatie van het aangeboren immuunsysteem. Deze arm van de immuniteit omvat “Innate Lymphoid Cells” (ILCs) die een essentiële taak vervullen in homeostase van de darmbarrière. Acute HIV infectie veroorzaakt verlies van ILCs in bloed en een verandering van hun functionaliteit in SLOs. We weten echter niet of ILC depletie ook gebeurt in SLOs en of de functionele modificaties de infectie beïnvloeden. Waarschijnlijk speelt de chronische ontstekingsreactie die HIV induceert een rol in deze processen, maar het precieze mechanisme blijft ongekend. Bijkomend werd nooit onderzocht of ART een impact heeft op deze effecten. In dit project zullen we deze vragen beantwoorden door stalen van (on)behandelde HIV patiënten te onderzoeken. We zullen ILC depletie in SLOs karakteriseren, het epigenoom/transcriptoom van overlevende ILCs in kaart brengen en het perifere inflammatoire milieu in HIV patiënten beschrijven. Via bio-informatica zullen we deze data holistisch analyseren om de impact van HIV op ILCs beter te begrijpen. Uiteindelijk willen we onze bevindingen valideren en verder onderzoeken in een gehumaniseerd muismodel.