-
Medical and health sciences
- Bioinformatics data integration and network biology
- Computational transcriptomics and epigenomics
- Epigenetics
- Posttranslational modifications
- Cancer biology
Juveniele myelomonocytaire leukemie (JMML) is een agressieve, complexe en zeldzame vorm van kinderkanker. Ondanks de identificatie van 5 genetische subtypes, kan de geobserveerde fenotypische en prognostische heterogeniteit van patiënten niet volledig verklaard worden. Daarom verdiepen onderzoekers zich nu in het epigenoom en transcriptoom om de genactiviteit beter te begrijpen. Zo is DNA-methylering naar voor gekomen als de meest betrouwbare voorspeller van klinische uitkomst in JMML. In dit project wil ik het inzicht in epigenetische mechanismen in JMML uitbreiden naar histon post-translationele modificaties (hPTMs). hPTMs zijn cruciale regulatoren van de genfunctie. Ik zal ook dieper ingaan op de vertaling van mRNA naar eiwitten, omdat dit de plaats is waar het fenotype van de ziekte echt ontstaat. Het includeren van het proteoom biedt een aanvullende dimensie, die mogelijk tot ongekende inzichten in de pathobiologie van JMML kan leiden. Uiteindelijk zal ik een volledige integratie van klinische, genoom, epigenoom, transcriptoom en proteoom data uitvoeren voor een cohorte van JMML-patiënten. Deze multi-omics aanpak zal het mogelijk maken om de JMML subtypes te verfijnen op basis van de onderliggende biologische mechanismen en klinische uitkomst. Deze verfijnde subtypering sluit aan bij een groeiende trend in kankeronderzoek naar gepersonaliseerde geneeskunde. Een beter begrip van de pathobiologie kan leiden tot een betere inschatting van prognose en behandeling van JMML.