Plantenwortels groeien continu, een unieke eigenschap die hen de mogelijkheid geeft om de bodem te verkennen voor voedingsstoffen en water. Stamcellen, gelegen in het meristeem van de wortelpunt, zorgen voor een continue toevoer van verschillende soorten cellen voor wortelgroei. Ondanks de identificatie van belangrijke mechanismen, is het nog niet ontrafeld hoe de identiteit of differentiatie van stamcellen wordt gereguleerd en gehandhaafd. Bovendien bemoeilijkt de complexiteit van het wortelmeristeem in zaadplanten, die verschillende types stamcellen heeft, dit onderzoek. In tegenstelling tot zaadplanten hebben de wortels van de evolutionair eerder ontstane plantengroepen varens en lycofyten slechts één stamcel en een minder complex meristeem. Hun momenteel onbekende mechanismen in de controle van stamcellen en differentiatie kunnen inzichten geven in hoe wortelstamcelcontrole evolueerde. Een voor plantenwetenschap opkomende techniek, namelijk single cell RNAseq, biedt een ongekende resolutie in genexpressiepatronen en opent de weg om belangrijke ontwikkelingsregulatoren te ontdekken die het lot van de cel regelen. We zijn er daarom sterk van overtuigd dat het momentum is gekomen om scRNAseq toe te passen op lycofyt- en varenwortels om de minimale of mogelijk alternatieve vereisten voor het lot van stamcellen of typespecifieke differentiatie te identificeren.