-
Natural sciences
- Applied and interdisciplinary physics
- (Bio)molecular modelling and design
- Medicinal and biomolecular chemistry not elsewhere classified
-
Medical and health sciences
- Molecular biophysics
- Biomolecular modelling and design
De escalerende incidentie van bacteriële infecties en de daaruit voortvloeiende antibioticaresistentie vormen een kritieke uitdaging voor de gezondheidswetenschappen, wat het vinden van nieuwe doelwitten voor geneesmiddelen in pathogene bacteriën noodzakelijk maakt. Choline-gemedieerde decoratie van de bacteriële celwand is een cruciale modulator voor overleving, virulentie en antibioticaresistentie in pathogene bacteriën zoals s. pneumoniae. De bepaling van de kristalstructuur van LicB, een transporter betrokken bij deze choline importroute, en daaropvolgende in vitro studies hebben LicB bevestigd als een veelbelovend potentieel geneesmiddeldoelwit. In dit project willen we het therapeutisch potentieel van LicB onderzoeken om nieuwe antibiotica te ontwikkelen. Onze belangrijkste doelstellingen zijn het identificeren van de moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan het LicB choline importproces met behulp van geavanceerde biomoleculaire simulaties en versnelde sampling technieken. Op basis van de data op moleculair niveau verkregen uit modellering, en gekoppeld aan de experimentele gegevens, zullen we een reeks structuurgebaseerde virtuele screeningstudies uitvoeren om nieuwe kleine molecule-inhibitoren van LicB te identificeren. Het resultaat van deze studie zal dienen als springplank voor de ontwikkeling van potentiële antibiotica tegen resistente stammen van pathogene bacteriën.