Microbiële gemeenschappen spelen een unieke rol in bioprocessen voor bio-energie herwinning, bioproductie en nutriënten herwinning. Huidige monitoring focust op analyses naar samenstelling, maar deze negeren de 3-dimensionele microbiële structuur. Daarom is een nieuwe benadering voor directe sturing van microbiële gemeenschappen essentieel om opportuniteiten in de bio-gebaseerde economie te onderzoeken. Dit project mikt op het verwerven en toepassen van fundamentele inzichten in microbiële 3D organisatie. Anaerobe granules zullen gebruikt worden, vanwege hun unieke organisatie, gericht op het herwinnen van hernieuwbare energie uit organische afvalstromen. Synthetische granules zullen ontworpen worden met een specifieke samenstelling en organisatie voor specifieke toepassingen. Natuurlijke granules zullen gecombineerd worden met synthetische granules voor processturing. Nieuw on-line technieken voor het monitoren van microbiële organisatie en activiteit zullen ontwikkeld en gevalideerd worden. De succesvolle integratie van deze doelstellingen zal resulteren in fundamentele kennis en maken hypothese-gedreven onderzoek mogelijk van de microbiële 3D organisatie in anaerobe granules en daarbuiten.