In virologie kan massaal parallel sequentionering (MPS) technology gebruikt worden voor de studie van quasispecies in HIV-1 en HCV geinfecteerde patienten, wat belangrijk is voor het begrijpen van de mechanismes voor resistentie en voor het verbeteren van de behandeling. In dit project worden statistische methoden ontwikkeld voor de identificatie en kwantificatie van virale varianten, gebruikt makend van de Illumina MPS technologie.