-
Natural sciences
- Computational evolutionary biology, comparative genomics and population genomics
- Biogeography and phylogeography
- Molecular evolution
- Phylogeny and comparative analysis
- Mycology
Gedurende de laatste twee decennia werden vele Basidiomycota (fungi) ontdekt welke hun voedingsstoffen verkrijgen van andere fungi, een strategie bekend als mycoparasitisme. Veel van deze soorten blijken heel oude groepen te zijn, welke reeds vroeg evolueerden toen de Basidiomycota van de Ascomycota afslpitsten. Echter, voor veel van deze soorten ontbreken relevante gegevens om het evolutionaire belang van mycoparasitisme te interpreteren. In dit project worden krachten gebundeld met Europese specialisten om deze te achterhalen en samen te brengen. Zo zullen we een licht kunnen schijnen op de evolutie van mycoparasitisme en geassocieerde kenmerken. Deze omvatten gespecialiseerde cellen en organellen voor interactie (haustoria en colacosomen resp.) en het fenomeen waarbij een mycoparasiet in zijn gastheer groeit (intrahymeniale groei). Hiervoor zullen gespecialiseerde cultuur- en DNA extractie methodes en elektronen microscopie worden toegepast. Verder zullen genomen van vier mycoparasieten worden gesequeneerd en geanalyseerd om genen gelinkt aan mycoparasitisme te vinden. Verder zal ook onderzocht worden hoe deze zich verhouden tot de genomen van nauw verwante plant pathogene fungi. Dit geheel zal toelaten om de evolutie en vroege diversificatie van Basidiomycota beter te begrijpen en kan toekomst perspectieven bieden voor biologische controle van belangrijke (plant) pathogene fungi, omdat deze als gastheer zouden kunnen dienen voor bepaalde mycoparasieten.